262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0377 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  100 
 
 		 457 aa  869    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  85.85 
 
 		 434 aa  630  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  72.02 
 
 		 442 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  72.07 
 
 		 450 aa  565  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  71.33 
 
 		 442 aa  559  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  70.02 
 
 		 458 aa  541  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  34.88 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  33.85 
 
 		 480 aa  153  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  34.09 
 
 		 476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  35.99 
 
 		 474 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  35.03 
 
 		 425 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  34.83 
 
 		 450 aa  142  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  34.48 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  32.56 
 
 		 485 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  34.32 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  33.18 
 
 		 420 aa  134  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  33.49 
 
 		 435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  25.73 
 
 		 495 aa  133  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  32 
 
 		 422 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  35.24 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  33.41 
 
 		 445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  33.02 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  25.96 
 
 		 495 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  36.16 
 
 		 439 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  32.45 
 
 		 469 aa  123  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  32.03 
 
 		 415 aa  123  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  33.64 
 
 		 456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  26.32 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  28.05 
 
 		 479 aa  120  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  33.87 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  34.22 
 
 		 504 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  36.63 
 
 		 476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  32.3 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  32.83 
 
 		 413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  31.25 
 
 		 409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  32.79 
 
 		 422 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  27.42 
 
 		 445 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  33.82 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  33.25 
 
 		 438 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  28.93 
 
 		 466 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  31.99 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  30.46 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  30.58 
 
 		 420 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  29.93 
 
 		 424 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  26.58 
 
 		 470 aa  96.7  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  31.16 
 
 		 463 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  33.57 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  28.94 
 
 		 481 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  28.86 
 
 		 657 aa  90.9  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  26.36 
 
 		 468 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  28.38 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  28.37 
 
 		 1199 aa  88.6  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  28.38 
 
 		 433 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  33.82 
 
 		 407 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  33.94 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  29.55 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  27.02 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  30.89 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  27.56 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  30.22 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  29.83 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  28.21 
 
 		 484 aa  71.2  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  44.79 
 
 		 537 aa  69.7  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  32.96 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  30.66 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  27.41 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  25.33 
 
 		 628 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  27.29 
 
 		 494 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  26.56 
 
 		 422 aa  67  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  27.14 
 
 		 578 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 494 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  47.14 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  28.08 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  23.65 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  45.83 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  45.83 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  28.08 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  28.08 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  26.98 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  29.93 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  24.33 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  25.45 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  33.08 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  52.38 
 
 		 510 aa  61.6  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  53.57 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  28.2 
 
 		 498 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  28.74 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  56.25 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  48.28 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  40.48 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  26.64 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  26.02 
 
 		 532 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  51.79 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  54.24 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  25.78 
 
 		 498 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  28.8 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  25.78 
 
 		 498 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  53.33 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  26.85 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  53.45 
 
 		 444 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>