266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4430 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  746    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  746    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  99.73 
 
 
372 aa  744    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4991  hypothetical protein  69.02 
 
 
371 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.50823  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  69.84 
 
 
372 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10924  hypothetical protein  64.78 
 
 
372 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  57.67 
 
 
409 aa  391  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  53.47 
 
 
360 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0118  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  54 
 
 
353 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  53.01 
 
 
371 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  52.84 
 
 
385 aa  350  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  50 
 
 
386 aa  346  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  53.37 
 
 
365 aa  345  8e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  50.67 
 
 
367 aa  342  5e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  52.66 
 
 
396 aa  331  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  49.4 
 
 
393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  53.95 
 
 
388 aa  290  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  45.02 
 
 
336 aa  285  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  47.88 
 
 
358 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  48.49 
 
 
403 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  44.71 
 
 
369 aa  260  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  48.26 
 
 
374 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  48.96 
 
 
374 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  48.26 
 
 
374 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  48.26 
 
 
374 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  41.52 
 
 
362 aa  256  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  50.19 
 
 
374 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  40.36 
 
 
383 aa  255  8e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  48.26 
 
 
374 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  42.11 
 
 
357 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  44.12 
 
 
368 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  43.81 
 
 
374 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  44.97 
 
 
358 aa  250  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  44.24 
 
 
376 aa  250  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0773  outer membrane protein expression inhibitor  39.38 
 
 
375 aa  249  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000136723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  43.12 
 
 
363 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  43.65 
 
 
380 aa  248  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1327  Zn-dependent hydrolase  42.04 
 
 
351 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  44.18 
 
 
318 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  45.49 
 
 
381 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  42.41 
 
 
351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  44.04 
 
 
376 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10098  hypothetical protein  37.16 
 
 
377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.906022  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  43.73 
 
 
363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  41.21 
 
 
358 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  45.14 
 
 
376 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0291  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  45.73 
 
 
372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000136484 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2047  beta-lactamase domain protein  37.85 
 
 
363 aa  242  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517312 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2503  hypothetical protein  39.06 
 
 
320 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00407253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2688  hypothetical protein  39.06 
 
 
320 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3323  hypothetical protein  41.64 
 
 
363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.992369  normal  0.0935261 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  38.12 
 
 
364 aa  239  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  43.56 
 
 
350 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1659  outer membrane protein  36.61 
 
 
376 aa  239  8e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.276517  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  39.71 
 
 
362 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2724  hypothetical protein  38.75 
 
 
320 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000835291  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2454  outer membrane protein RomA  39.41 
 
 
320 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.023558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2703  hypothetical protein  38.44 
 
 
320 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340422 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2708  outer membrane protein RomA  38.01 
 
 
320 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  45.88 
 
 
356 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0332  multidrug resistance protein RomA  38.25 
 
 
333 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0128421  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  44.37 
 
 
356 aa  235  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3548  hypothetical protein  45.13 
 
 
366 aa  235  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2601  outer membrane protein RomA  38.01 
 
 
320 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  43.13 
 
 
364 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3122  metallo-beta-lactamase family protein  44.95 
 
 
355 aa  232  9e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2793  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  37.69 
 
 
378 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1004  hypothetical protein  37.58 
 
 
361 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  44.49 
 
 
367 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1097  Zn-dependent hydrolase  43.93 
 
 
366 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1916  putative lipoprotein  36.54 
 
 
361 aa  222  6e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1077  beta-lactamase domain-containing protein  36.46 
 
 
367 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.600818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  43.56 
 
 
332 aa  213  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4699  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.43 
 
 
367 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5728  hypothetical protein  36.45 
 
 
377 aa  209  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.340151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  33.24 
 
 
380 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1076  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  43.06 
 
 
419 aa  204  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  36.8 
 
 
392 aa  202  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  38.54 
 
 
414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0851  hypothetical protein  31.79 
 
 
320 aa  193  5e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.424638  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0781  hypothetical protein  31.48 
 
 
320 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0380986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2131  hypothetical protein  33.23 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  36.89 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  36.39 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  36.39 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1399  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.69 
 
 
354 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0621512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2469  hypothetical protein  32.31 
 
 
353 aa  176  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1685  hypothetical protein  40.47 
 
 
303 aa  175  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000226604  hitchhiker  0.00000586595 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  41.3 
 
 
357 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.27 
 
 
325 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  42.25 
 
 
335 aa  172  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0248  beta-lactamase domain protein  37.72 
 
 
353 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1593  twin-arginine translocation pathway signal  37.58 
 
 
336 aa  169  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.771059 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3326  putative lipoprotein  34.52 
 
 
335 aa  169  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2484  hypothetical protein  40 
 
 
328 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.171929  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1139  hypothetical protein  36.84 
 
 
362 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12530  hypothetical protein  36.53 
 
 
361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3346  beta-lactamase domain-containing protein  39.43 
 
 
329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3314  twin-arginine translocation pathway signal  40.15 
 
 
344 aa  165  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.837429  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0218  twin-arginine translocation pathway signal  36.3 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  hitchhiker  0.0076706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>