93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1599 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1599  secreted hydrolase-like protein  100 
 
 
663 aa  1348    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000036978  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2019  hypothetical protein  30.18 
 
 
375 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000706045 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1194  hypothetical protein  29.45 
 
 
371 aa  140  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000162993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4754  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase  30.27 
 
 
383 aa  138  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772037  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1006  hypothetical protein  27.83 
 
 
378 aa  138  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2208  hypothetical protein  29.04 
 
 
375 aa  137  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.543456  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1194  hypothetical protein  30 
 
 
360 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1415  hypothetical protein  29.34 
 
 
387 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.541755  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3480  secreted hydrolase-like protein  28.57 
 
 
358 aa  128  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2186  hypothetical protein  28.94 
 
 
389 aa  123  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0002  secreted hydrolase-like protein  28.74 
 
 
387 aa  122  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000706868  unclonable  0.000000000576659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0065  secreted hydrolase-like protein  27.25 
 
 
376 aa  117  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1837  hypothetical protein  30.21 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0653  hypothetical protein  27.22 
 
 
408 aa  115  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0803  hypothetical protein  26.95 
 
 
380 aa  114  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0192  secreted hydrolase-like protein  27.03 
 
 
374 aa  114  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400683  normal  0.94158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1774  hypothetical protein  28.2 
 
 
370 aa  113  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341768  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1922  hypothetical protein  29.41 
 
 
392 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1458  secreted hydrolase-like protein  27.86 
 
 
372 aa  111  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1993  secreted hydrolase-like protein  28.96 
 
 
413 aa  110  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11006  hypothetical protein  26.61 
 
 
386 aa  107  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.19907e-56  normal  0.122138 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3629  putative AttH  26.45 
 
 
367 aa  107  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00823607  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3228  secreted hydrolase-like  25.45 
 
 
364 aa  107  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2048  hypothetical protein  26.11 
 
 
374 aa  107  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.356094  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2143  hypothetical protein  26.43 
 
 
387 aa  105  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2041  hypothetical protein  28.22 
 
 
390 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.010776  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0893  putative AttH  26.49 
 
 
386 aa  101  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.27416  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5005  secreted hydrolase-like protein  25.19 
 
 
513 aa  100  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  hitchhiker  0.00394498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1642  putative AttH  26.27 
 
 
389 aa  100  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384305  normal  0.0577815 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1313  hypothetical protein  25.6 
 
 
381 aa  99.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.447479  normal  0.673608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5157  secreted hydrolase-like protein  24.15 
 
 
374 aa  97.8  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1519  putative AttH  26.65 
 
 
392 aa  97.4  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2462  secreted hydrolase-like protein  24.72 
 
 
380 aa  93.2  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3745  hypothetical protein  25.68 
 
 
359 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114151  normal  0.0295635 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6017  hypothetical protein  26.7 
 
 
356 aa  90.5  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3116  secreted hydrolase-like protein  24.36 
 
 
380 aa  89.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1286  secreted hydrolase-like protein  24.36 
 
 
377 aa  89  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0866  hypothetical protein  25 
 
 
390 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3509  hypothetical protein  24.79 
 
 
394 aa  87.8  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4108  hypothetical protein  22.51 
 
 
390 aa  87.8  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1636  hypothetical protein  25.23 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4398  hypothetical protein  22.89 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117298  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1279  hypothetical protein  25.36 
 
 
409 aa  84.3  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000467326 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2668  hypothetical protein  25.84 
 
 
362 aa  84  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00325621  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1580  putative secreted hydrolase  25.63 
 
 
375 aa  84  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125275  normal  0.120908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1886  Protein of unknown function DUF2006  26.36 
 
 
341 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0752233  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0344  hypothetical protein  24.28 
 
 
362 aa  82  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0639153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4688  hypothetical protein  24.79 
 
 
362 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0831  hypothetical protein  24.3 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0554  hypothetical protein  22.8 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.817301  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1611  hypothetical protein  24.55 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1176  hypothetical protein  24.21 
 
 
335 aa  80.1  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00359132  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0854  hypothetical protein  23.96 
 
 
404 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2030  secreted hydrolase-like protein  25.15 
 
 
351 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4472  secreted hydrolase-like protein  30.1 
 
 
360 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214249  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2555  putative lipoprotein  25.81 
 
 
352 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3733  ABC transporter lipoprotein, putative  24.85 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142601  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2173  putative lipoprotein  24.62 
 
 
351 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.296969  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0711  hypothetical protein  22.05 
 
 
416 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0255  hypothetical protein  22.22 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0625  hypothetical protein  22.13 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3311  hypothetical protein  22.7 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5298  hypothetical protein  24.21 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6286  hypothetical protein  23.19 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3352  hypothetical protein  23.64 
 
 
354 aa  73.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001048  hypothetical protein  23.54 
 
 
374 aa  73.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01330  predicted secreted hydrolase  21.81 
 
 
450 aa  72  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101344  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3146  hypothetical protein  27.4 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3423  hypothetical protein  22.19 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2642  putative lipoprotein  22.54 
 
 
384 aa  70.5  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04770  hydrolase  21.43 
 
 
369 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2028  hypothetical protein  22.83 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0855  hypothetical protein  27.65 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3020  secreted hydrolase-like protein  24.17 
 
 
364 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0547861  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3955  hypothetical protein  21.5 
 
 
393 aa  67  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779914  normal  0.022032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3203  hypothetical protein  21.79 
 
 
412 aa  65.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1686  Protein of unknown function DUF2006  25.36 
 
 
384 aa  64.3  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0078  hypothetical protein  22.61 
 
 
346 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0311  hypothetical protein  25.29 
 
 
360 aa  61.6  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0684  hypothetical protein  24.15 
 
 
360 aa  58.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1540  secreted hydrolase  22.51 
 
 
364 aa  57.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5452  secreted hydrolase-like protein  25.39 
 
 
264 aa  57  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2957  hypothetical protein  25.23 
 
 
400 aa  55.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.338576 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003768  hypothetical protein  21.5 
 
 
374 aa  55.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1176  hypothetical protein  23.58 
 
 
355 aa  54.7  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000944356  normal  0.803843 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0191  secreted hydrolase  23.53 
 
 
364 aa  54.3  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212117  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02647  hydrolase  21.94 
 
 
374 aa  50.8  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  27.46 
 
 
239 aa  47.8  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  34.38 
 
 
274 aa  47.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2888  hypothetical protein  20.69 
 
 
375 aa  46.6  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.179405  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  31.03 
 
 
239 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  50 
 
 
311 aa  45.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2732  hypothetical protein  29.19 
 
 
296 aa  44.3  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>