More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0545 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0545  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  505  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2983  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.08 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000906081  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2473  DNA-binding response regulator  48.35 
 
 		 242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  48.95 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3730  winged helix family two component transcriptional regulator  48.95 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  49.37 
 
 		 238 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01583  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.81 
 
 		 237 aa  222  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003939  TorCAD operon transcriptional regulatory protein TorR  46.15 
 
 		 236 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0753413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2052  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.21 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293024  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5717  putative two-component response regulator  47.68 
 
 		 245 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65880  putative two-component response regulator  47.68 
 
 		 244 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0780512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1322  DNA-binding transcriptional regulator TorR  47.01 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000612091  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  46.28 
 
 		 251 aa  208  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1828  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.28 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.66 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  45.57 
 
 		 232 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  45.57 
 
 		 232 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1985  DNA-binding transcriptional regulator TorR  45.73 
 
 		 232 aa  205  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.03 
 
 		 236 aa  205  6e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.06 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0200  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 		 243 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1874  two component transcriptional regulator  46 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  46.06 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.42 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  46.84 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3566  two component transcriptional regulator  45.42 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.291783  normal  0.121657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  43.15 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  44.03 
 
 		 245 aa  195  7e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  44.03 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3367  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.44 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0570  two-component response regulator  42.26 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.275144  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.89 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1150  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.89 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  44.9 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3356  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.89 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.89 
 
 		 236 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.57 
 
 		 275 aa  191  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2803  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.28 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3865  two-component response regulator  41.95 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000288449  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3671  two-component response regulator  41.95 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0562  two-component response regulator  41.53 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0713  two-component response regulator  40.93 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0531  two-component response regulator  41.95 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.26 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  43.83 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1112  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.25 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1051  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.25 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.44318 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4949  two-component response regulator  41.53 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1047  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.25 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.499715  normal  0.229032 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04277  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with ArcB or CpxA  41.53 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.896117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3596  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5916  two-component response regulator  41.53 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.284367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3655  two-component response regulator  41.53 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0681  two-component response regulator  41.53 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000276194  normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4637  two-component response regulator  41.53 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4952  two-component response regulator  41.53 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal  0.89803 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04242  hypothetical protein  41.53 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.889846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5000  two-component response regulator  41.53 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0983  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.67 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.291581 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4922  two-component response regulator  41.53 
 
 		 238 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000490343  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5008  two-component response regulator  41.53 
 
 		 238 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.80206 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4849  two-component response regulator  41.53 
 
 		 238 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5012  two-component response regulator  41.53 
 
 		 238 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0537303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4956  two-component response regulator  41.53 
 
 		 238 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.211871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3478  two-component response regulator  41.1 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3347  DNA-binding transcriptional regulator TorR  44.77 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 238 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1228  DNA-binding transcriptional regulator TorR  46.28 
 
 		 236 aa  186  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3606  two-component response regulator  40.68 
 
 		 238 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0811  two-component response regulator  40.68 
 
 		 238 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1990  DNA-binding transcriptional regulator TorR  44.63 
 
 		 241 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697946  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00276  two-component response regulator  40.59 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1947  two-component response regulator  40.68 
 
 		 238 aa  185  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000743409  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00933  two-component response regulator  40.68 
 
 		 238 aa  185  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0533  two-component response regulator  41 
 
 		 238 aa  185  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  41.67 
 
 		 239 aa  184  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  41.32 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  41.67 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  41.32 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  41.32 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  41.67 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  41.67 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  41.67 
 
 		 239 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  41.67 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2558  two-component response regulator  39.26 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004461  aerobic respiration control protein ArcA  40.25 
 
 		 238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000105121  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.4 
 
 		 239 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2647  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.03 
 
 		 230 aa  183  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149157  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3988  two-component response regulator  40.25 
 
 		 238 aa  183  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  41.7 
 
 		 241 aa  183  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01005  hypothetical protein  44.03 
 
 		 230 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0651  two-component response regulator  40.25 
 
 		 238 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000404261  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3371  two-component response regulator  40.25 
 
 		 238 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000464227  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>