More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0044 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  100 
 
 
327 aa  664  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  96.33 
 
 
327 aa  625  1e-178  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  97.21 
 
 
323 aa  619  1e-176  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  80.8 
 
 
323 aa  533  1e-150  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  68.52 
 
 
324 aa  468  1e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  46.89 
 
 
331 aa  313  3e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  46.27 
 
 
326 aa  308  1e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  45.62 
 
 
336 aa  305  8e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  43.83 
 
 
330 aa  302  5e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  44.58 
 
 
321 aa  297  1e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  43.96 
 
 
338 aa  286  4e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  42.19 
 
 
331 aa  285  1e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  39.88 
 
 
333 aa  276  4e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  33.44 
 
 
328 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  33.43 
 
 
331 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  33.02 
 
 
342 aa  185  9e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  32.19 
 
 
332 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  32.32 
 
 
331 aa  176  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  34.57 
 
 
323 aa  175  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  32.71 
 
 
328 aa  175  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  32.79 
 
 
341 aa  175  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  31.71 
 
 
328 aa  173  4e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  31.17 
 
 
331 aa  173  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  29.45 
 
 
327 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  29.45 
 
 
327 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  29.82 
 
 
325 aa  149  8e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  30.37 
 
 
334 aa  148  2e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  30.98 
 
 
326 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  28.73 
 
 
338 aa  141  2e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  32.02 
 
 
479 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  31.6 
 
 
486 aa  131  1e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  32 
 
 
481 aa  126  4e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  30.71 
 
 
471 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  25.95 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  31.11 
 
 
313 aa  82.4  9e-15  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  25.42 
 
 
332 aa  77  4e-13  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  25 
 
 
318 aa  75.5  1e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  25.34 
 
 
318 aa  74.7  2e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  25.33 
 
 
318 aa  74.3  2e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  26.19 
 
 
331 aa  74.7  2e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  25.47 
 
 
323 aa  75.1  2e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  25.34 
 
 
318 aa  73.9  3e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  24.84 
 
 
323 aa  73.6  5e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  26.77 
 
 
325 aa  73.6  5e-12  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  25.57 
 
 
318 aa  72.8  8e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  7.43717e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  24 
 
 
348 aa  71.2  2e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  25.97 
 
 
333 aa  70.5  3e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  25.33 
 
 
323 aa  70.9  3e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  24.02 
 
 
328 aa  70.5  4e-11  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  6.57698e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  25 
 
 
323 aa  70.1  4e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  25 
 
 
323 aa  70.5  4e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  8.40757e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  28.31 
 
 
326 aa  69.7  6e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  25 
 
 
323 aa  69.7  7e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  24.32 
 
 
344 aa  68.9  1e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1022  selenophosphate synthetase  28.77 
 
 
359 aa  67.8  2e-10  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.99112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  22.57 
 
 
347 aa  67.4  3e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  24.67 
 
 
343 aa  67.4  3e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  25 
 
 
343 aa  67  5e-10  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  25 
 
 
344 aa  66.6  5e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  23.66 
 
 
326 aa  66.2  7e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  23.66 
 
 
326 aa  66.2  7e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  23.66 
 
 
326 aa  66.2  8e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1060  AIR synthase related protein-like protein  26.55 
 
 
327 aa  65.9  9e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0149128  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  23.66 
 
 
326 aa  65.9  9e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  27 
 
 
315 aa  65.9  9e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0823  selenophosphate synthetase  26.36 
 
 
344 aa  65.9  9e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  0.0506627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0850  selenophosphate synthetase  26.36 
 
 
344 aa  65.9  1e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  22.67 
 
 
321 aa  65.9  1e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  26.36 
 
 
344 aa  65.1  1e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  27.76 
 
 
319 aa  65.1  2e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  22.88 
 
 
346 aa  64.7  2e-09  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  25.99 
 
 
350 aa  64.7  2e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  25.99 
 
 
317 aa  64.3  3e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  25.86 
 
 
317 aa  63.5  4e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  28.57 
 
 
355 aa  63.5  4e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4363  selenophosphate synthetase  25.91 
 
 
344 aa  63.9  4e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.040516  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  26.19 
 
 
354 aa  63.9  4e-09  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  1.45839e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  28.57 
 
 
351 aa  63.2  5e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  28.3 
 
 
378 aa  63.2  5e-09  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  24.61 
 
 
347 aa  62.8  7e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  8.15299e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  24.68 
 
 
319 aa  62.8  7e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.68907e-05  unclonable  8.63796e-11 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  26.96 
 
 
343 aa  62.8  7e-09  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.08 
 
 
716 aa  62  1e-08  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.191388  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2397  selenide, water dikinase  25.38 
 
 
353 aa  62  1e-08  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  27.93 
 
 
344 aa  62  1e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1539  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30.5 
 
 
717 aa  62  1e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  23.05 
 
 
335 aa  62  1e-08  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  4.11831e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  23.31 
 
 
336 aa  62  1e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  24.33 
 
 
319 aa  62.4  1e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  25.1 
 
 
291 aa  61.6  2e-08  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  22.77 
 
 
334 aa  61.6  2e-08  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  25.89 
 
 
327 aa  61.6  2e-08  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  22.26 
 
 
321 aa  61.2  2e-08  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  26.98 
 
 
309 aa  60.8  3e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  25 
 
 
319 aa  60.8  3e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  2.16996e-08 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  24.92 
 
 
326 aa  60.5  4e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  26.04 
 
 
330 aa  60.5  4e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  26.53 
 
 
337 aa  60.5  4e-08  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  25.12 
 
 
319 aa  60.1  5e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5279  selenide, water dikinase  25.63 
 
 
335 aa  60.1  5e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>