More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0124 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  100 
 
 
403 aa  785    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  48.72 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  45.41 
 
 
415 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  44.53 
 
 
419 aa  298  8e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  43.67 
 
 
421 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  40.2 
 
 
403 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  46.43 
 
 
412 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 
416 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 
411 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  47.18 
 
 
411 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  43.04 
 
 
413 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  44.69 
 
 
423 aa  286  4e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  43.37 
 
 
451 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  45.13 
 
 
406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 
440 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  43.78 
 
 
405 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  42.25 
 
 
420 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  41.5 
 
 
415 aa  278  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  44.65 
 
 
408 aa  277  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  44.39 
 
 
408 aa  276  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  44.39 
 
 
408 aa  276  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  44.27 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  44.27 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  42.64 
 
 
408 aa  273  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  44.97 
 
 
360 aa  272  8.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  43.99 
 
 
410 aa  269  8e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  45.83 
 
 
429 aa  269  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  44.82 
 
 
424 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 
422 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  42.86 
 
 
406 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  42.61 
 
 
409 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  43.37 
 
 
406 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  43.11 
 
 
406 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  42.28 
 
 
418 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  42.28 
 
 
420 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 
406 aa  265  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  39.07 
 
 
410 aa  262  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  38.71 
 
 
433 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  42.46 
 
 
403 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 
479 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  45.71 
 
 
421 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  42.64 
 
 
413 aa  259  8e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  42.46 
 
 
406 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  43.51 
 
 
415 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  39.12 
 
 
427 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  40.25 
 
 
399 aa  256  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 
406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  41.43 
 
 
403 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  42.93 
 
 
404 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 
412 aa  249  5e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  39.65 
 
 
414 aa  249  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  43.8 
 
 
424 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  41.1 
 
 
427 aa  247  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  40.99 
 
 
437 aa  247  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  42.17 
 
 
412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  42.6 
 
 
412 aa  246  6.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  42.21 
 
 
416 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  43.01 
 
 
397 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  41.67 
 
 
416 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  39.25 
 
 
454 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  41.67 
 
 
416 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  41.67 
 
 
416 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  41.67 
 
 
416 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  38.73 
 
 
407 aa  237  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  38.56 
 
 
457 aa  235  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  40.66 
 
 
416 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  39.89 
 
 
421 aa  230  3e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  38.87 
 
 
455 aa  223  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  41.16 
 
 
416 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  39.52 
 
 
499 aa  220  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  35.35 
 
 
401 aa  219  6e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  38.2 
 
 
427 aa  219  7e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  35.29 
 
 
424 aa  218  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 
427 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 
416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  37.16 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 
418 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  35.19 
 
 
427 aa  209  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  36.31 
 
 
414 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 
415 aa  207  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  35.66 
 
 
418 aa  207  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 
425 aa  207  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  35.79 
 
 
401 aa  202  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  37.02 
 
 
410 aa  186  8e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 
428 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 
414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  33.7 
 
 
415 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  33.87 
 
 
415 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  33.79 
 
 
524 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  33.52 
 
 
505 aa  136  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 
453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 
422 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 
438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 
436 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  30.48 
 
 
431 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  29.24 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  29.48 
 
 
443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  31.2 
 
 
418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>