More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1205 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  744    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  47.61 
 
 
413 aa  320  3e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  40.99 
 
 
383 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  38.66 
 
 
377 aa  268  1e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  38.66 
 
 
377 aa  268  1e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  36.58 
 
 
374 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  36.32 
 
 
374 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  40.06 
 
 
406 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  38.92 
 
 
376 aa  257  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  34.25 
 
 
373 aa  247  2e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  42.86 
 
 
384 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  34.55 
 
 
370 aa  242  7.999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  41.67 
 
 
373 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  41.07 
 
 
430 aa  239  5e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  41.11 
 
 
372 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  39.21 
 
 
385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  35.23 
 
 
368 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  39.45 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  38.19 
 
 
374 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  37.64 
 
 
374 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  38.36 
 
 
374 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  37.91 
 
 
374 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  37.91 
 
 
447 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  38.92 
 
 
383 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  34.36 
 
 
369 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  41.59 
 
 
384 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  39.04 
 
 
383 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  34.08 
 
 
369 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  40.96 
 
 
366 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  34.08 
 
 
369 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  39.46 
 
 
365 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  41.82 
 
 
366 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  41.29 
 
 
368 aa  227  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  40.66 
 
 
366 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  40 
 
 
383 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  39.67 
 
 
382 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  40.18 
 
 
377 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  39.06 
 
 
370 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  40.81 
 
 
377 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  38.69 
 
 
388 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  39.64 
 
 
377 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  39.84 
 
 
381 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  40.11 
 
 
364 aa  223  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  40.93 
 
 
381 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  37.91 
 
 
396 aa  223  4e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0403  hypothetical protein  38.67 
 
 
374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00912945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  37.47 
 
 
379 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  39.77 
 
 
370 aa  222  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  37.98 
 
 
378 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  37.95 
 
 
378 aa  222  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  40.87 
 
 
377 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  37.64 
 
 
372 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  41.37 
 
 
377 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  38.36 
 
 
382 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  38.77 
 
 
368 aa  219  7e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  36.66 
 
 
382 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  39.25 
 
 
384 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  39.95 
 
 
376 aa  217  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  35.95 
 
 
382 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  38.44 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  39.76 
 
 
364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  39.08 
 
 
344 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  38.78 
 
 
377 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  40.62 
 
 
377 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  37.96 
 
 
378 aa  215  9e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  35.64 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  35 
 
 
375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  39.84 
 
 
367 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  44.67 
 
 
376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  36.12 
 
 
381 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  41.28 
 
 
378 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  35.91 
 
 
394 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0612  ABC transporter, permease protein  36.61 
 
 
374 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0431  putative ABC transporter, permease protein  36.61 
 
 
374 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.238842  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  37.69 
 
 
378 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  37.43 
 
 
377 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0450  putative ABC transporter, permease protein  36.61 
 
 
374 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0373  ABC transporter, permease protein  36.61 
 
 
404 aa  210  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  34.88 
 
 
384 aa  210  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  35.69 
 
 
378 aa  209  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  35.69 
 
 
378 aa  209  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  35.37 
 
 
374 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3201  putative ABC transporter, permease protein  36.34 
 
 
366 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0232  putative ABC transporter, permease protein  36.34 
 
 
366 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  35.37 
 
 
374 aa  209  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  34.32 
 
 
380 aa  209  8e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0066  ABC transporter, permease protein  36.34 
 
 
355 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1361  ABC transporter, permease protein  36.34 
 
 
428 aa  209  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  35.12 
 
 
388 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  39.4 
 
 
386 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  35.21 
 
 
382 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4225  ABC transporter inner membrane protein  35.56 
 
 
377 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.220227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  33.79 
 
 
376 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  35.53 
 
 
383 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2286  hypothetical protein  35.99 
 
 
425 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  35.2 
 
 
371 aa  203  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  35.41 
 
 
374 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  37.45 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  36.34 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  38.53 
 
 
474 aa  201  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>