48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3428 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  100 
 
 
163 aa  322  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  80.37 
 
 
163 aa  258  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  74.51 
 
 
157 aa  228  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  74.51 
 
 
157 aa  228  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  74.51 
 
 
157 aa  228  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  63.64 
 
 
166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  59.6 
 
 
154 aa  175  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  56.58 
 
 
155 aa  167  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  58.9 
 
 
152 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  56.86 
 
 
155 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  60.54 
 
 
174 aa  161  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  55.77 
 
 
160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  52.15 
 
 
163 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  55.19 
 
 
162 aa  157  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  51.97 
 
 
153 aa  156  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 
154 aa  155  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  53.38 
 
 
155 aa  154  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  53.21 
 
 
155 aa  151  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  49.67 
 
 
155 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  50.99 
 
 
162 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  55.28 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  52.29 
 
 
153 aa  145  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  50.67 
 
 
160 aa  142  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 
154 aa  141  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  47.71 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  52.67 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  50.66 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  49.68 
 
 
156 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  53.29 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  46.1 
 
 
172 aa  134  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  50 
 
 
324 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 
165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
154 aa  120  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 
154 aa  117  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  45.34 
 
 
166 aa  117  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 
162 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
324 aa  59.7  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  28.48 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 
341 aa  43.9  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  30.71 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 
229 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
156 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  33.07 
 
 
149 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
167 aa  40.8  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 
139 aa  40.8  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  41.33 
 
 
314 aa  40.4  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>