223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl080 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl080  30S ribosomal protein S6  100 
 
 
290 aa  572  1e-162  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  1.25992e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0024  30S ribosomal protein S6  62.79 
 
 
137 aa  179  3e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl447  putative histone-like/ribosomal-like protein  72.07 
 
 
285 aa  162  7e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.31524e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  36.17 
 
 
94 aa  62.4  8e-09  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  2.93762e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  33.6 
 
 
136 aa  60.5  3e-08  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  41 
 
 
101 aa  60.1  4e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  33.88 
 
 
132 aa  59.3  8e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2186  30S ribosomal protein S6  34.58 
 
 
117 aa  58.2  1e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  34.86 
 
 
135 aa  58.2  2e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  34.86 
 
 
132 aa  58.2  2e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 
161 aa  57.4  3e-07  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 
96 aa  56.6  4e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  6.11758e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 
96 aa  56.6  4e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 
96 aa  56.6  4e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.6821e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 
96 aa  56.6  4e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  7.42686e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 
122 aa  57  4e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 
96 aa  56.6  4e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.78233e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 
96 aa  56.6  4e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.55569e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  35.51 
 
 
131 aa  56.6  5e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  27.45 
 
 
139 aa  56.2  7e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  1.60404e-06 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 
96 aa  55.8  8e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 
96 aa  55.8  8e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  32.5 
 
 
126 aa  55.8  8e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 
96 aa  55.5  9e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.42081e-06  hitchhiker  6.88979e-07 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  28.8 
 
 
133 aa  55.5  1e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0645  30S ribosomal protein S6  35.51 
 
 
160 aa  55.1  1e-06  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.501453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  31.18 
 
 
95 aa  55.5  1e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  34.58 
 
 
124 aa  55.5  1e-06  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  34.41 
 
 
94 aa  55.1  1e-06  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 
125 aa  55.5  1e-06  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 
125 aa  55.5  1e-06  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  29.67 
 
 
95 aa  54.3  2e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  27.17 
 
 
135 aa  54.3  2e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4212  30S ribosomal protein S6  28.29 
 
 
139 aa  54.3  2e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553377  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3284  30S ribosomal protein S6  28.93 
 
 
135 aa  54.3  2e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0114214  hitchhiker  0.000227969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  29.17 
 
 
135 aa  54.7  2e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 
96 aa  54.3  2e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.06973e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  35.16 
 
 
155 aa  54.7  2e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  32.95 
 
 
153 aa  53.9  3e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3118  30S ribosomal protein S6  32.35 
 
 
152 aa  53.5  4e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158791  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1045  30S ribosomal protein S6  33.65 
 
 
117 aa  53.5  4e-06  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.146697 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  31.4 
 
 
148 aa  53.5  4e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5716  30S ribosomal protein S6  28.93 
 
 
131 aa  53.1  5e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.394601  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3793  ribosomal protein S6  28.93 
 
 
131 aa  53.1  5e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00794169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3813  30S ribosomal protein S6  28.93 
 
 
131 aa  53.1  5e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4671  30S ribosomal protein S6  28.93 
 
 
131 aa  53.1  5e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980923  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4733  30S ribosomal protein S6  28.93 
 
 
131 aa  53.1  5e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.387811  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4761  30S ribosomal protein S6  28.93 
 
 
131 aa  53.1  5e-06  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4444  30S ribosomal protein S6  28.93 
 
 
131 aa  53.1  5e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0371  30S ribosomal protein S6  29.75 
 
 
131 aa  53.1  5e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.080214  normal  0.0305615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04067  30S ribosomal protein S6  28.93 
 
 
131 aa  52.8  6e-06  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4659  30S ribosomal protein S6  28.93 
 
 
131 aa  53.1  6e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4751  30S ribosomal protein S6  28.93 
 
 
131 aa  53.1  6e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.502035  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4809  30S ribosomal protein S6  28.93 
 
 
131 aa  53.1  6e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.16196  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4669  30S ribosomal protein S6  28.93 
 
 
131 aa  53.1  6e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0711098  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0010  ribosomal protein S6  27.97 
 
 
146 aa  52.8  6e-06  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  4.37004e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04029  hypothetical protein  28.93 
 
 
131 aa  52.8  6e-06  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3351  30S ribosomal protein S6  26.9 
 
 
130 aa  52.8  7e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  2.74411e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  30.85 
 
 
96 aa  52.8  7e-06  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4934  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 
141 aa  52.8  7e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.04766e-05 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  35.51 
 
 
120 aa  52.8  7e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4668  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 
141 aa  52.8  7e-06  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0417729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4758  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 
141 aa  52.8  7e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0734543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4877  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 
141 aa  52.8  7e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 
125 aa  52.8  7e-06  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  29.79 
 
 
95 aa  52.4  8e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4787  30S ribosomal protein S6  28.93 
 
 
131 aa  52.4  9e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11072  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0534  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 
142 aa  52.4  9e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.587814  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 
153 aa  52  1e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07640  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 
136 aa  52  1e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  29.79 
 
 
95 aa  51.6  1e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  9.05863e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0645  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 
140 aa  52.4  1e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.793975  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3586  30S ribosomal protein S6  28.33 
 
 
137 aa  52  1e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0940753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0581  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 
141 aa  52.4  1e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0695  30S ribosomal protein S6  31.82 
 
 
109 aa  51.6  1e-05  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4933  ribosomal protein S6  33.33 
 
 
141 aa  52.4  1e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1622  30S ribosomal protein S6  31.43 
 
 
117 aa  52.4  1e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541746  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1433  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 
112 aa  51.2  2e-05  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  34.04 
 
 
98 aa  51.6  2e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  30.68 
 
 
109 aa  51.2  2e-05  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1197  30S ribosomal protein S6  33.64 
 
 
155 aa  51.2  2e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.358566  normal  0.0253087 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf696  ribosomal protein S6  26.67 
 
 
160 aa  50.8  2e-05  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  32.58 
 
 
98 aa  51.2  2e-05  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  33.71 
 
 
96 aa  51.2  2e-05  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  36.26 
 
 
95 aa  51.2  2e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1054  30S ribosomal protein S6  33.64 
 
 
155 aa  51.2  2e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.285791 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1550  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 
112 aa  51.2  2e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  28.33 
 
 
131 aa  50.4  3e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  7.03568e-06  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  28.33 
 
 
131 aa  50.4  3e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.2398e-05  hitchhiker  1.09167e-05 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  31.03 
 
 
117 aa  50.4  3e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  27.47 
 
 
160 aa  50.4  3e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65180  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 
139 aa  50.4  3e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2303  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 
151 aa  50.4  3e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5662  30S ribosomal protein S6  32.22 
 
 
139 aa  50.4  3e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 
96 aa  50.4  3e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  32.98 
 
 
96 aa  50.4  4e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 
159 aa  50.4  4e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 
96 aa  50.1  4e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 
96 aa  50.1  4e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  30.11 
 
 
131 aa  50.1  4e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>