More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0268 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 181 aa  357  7e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  88.95 
 
 		 181 aa  317  7.999999999999999e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  71.35 
 
 		 187 aa  266  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  62.43 
 
 		 196 aa  221  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  62.22 
 
 		 198 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  62.84 
 
 		 197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  60.11 
 
 		 313 aa  210  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  58.43 
 
 		 290 aa  207  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4606  resolvase domain-containing protein  66.43 
 
 		 140 aa  185  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  48.89 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  48.31 
 
 		 183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  46.96 
 
 		 185 aa  157  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  46.96 
 
 		 185 aa  157  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  46.41 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  44.75 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  45.3 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  45.3 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  45.3 
 
 		 186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  44.69 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  43.5 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  42.16 
 
 		 183 aa  130  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  39.55 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  43.48 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  42.31 
 
 		 190 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  43.17 
 
 		 205 aa  127  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  43.65 
 
 		 191 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  41.81 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  41.21 
 
 		 185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  39.56 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  41.99 
 
 		 196 aa  124  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  42.31 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  41.34 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  41.44 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  40.44 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  41.21 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  42.39 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  41.76 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  40.34 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  37.91 
 
 		 181 aa  118  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  41.57 
 
 		 188 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  44.38 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  40.45 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  38.76 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  40.22 
 
 		 193 aa  114  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  42.78 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  40.34 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  39.2 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  42.46 
 
 		 191 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  39.56 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  39.2 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  37.78 
 
 		 184 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  39.67 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  35.16 
 
 		 201 aa  107  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  38.64 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  36.07 
 
 		 192 aa  107  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  41.29 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  40.45 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  35.75 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  38.64 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  39.01 
 
 		 188 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  41.81 
 
 		 181 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  38.46 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  38.46 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  34.44 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  38.46 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  37.02 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  35.68 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  37.99 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  37.29 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  36.52 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  36.96 
 
 		 192 aa  104  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  38.46 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 		 199 aa  105  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  38.04 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  37.36 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  37.08 
 
 		 193 aa  103  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  40.45 
 
 		 184 aa  103  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  38.04 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  38.04 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0149  transposon resolvase  34.07 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015767 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  34.81 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  47.02 
 
 		 324 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0119  transposon resolvase  34.07 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.336282 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  39.07 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  39.66 
 
 		 185 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  38.12 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  37.36 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  39.78 
 
 		 219 aa  101  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  37.22 
 
 		 203 aa  101  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  36.11 
 
 		 203 aa  101  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>