More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1589 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  100 
 
 		 191 aa  393  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  64.4 
 
 		 195 aa  246  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  61.34 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  60.82 
 
 		 198 aa  244  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2081  putative cytochrome c  59.28 
 
 		 194 aa  213  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  33.65 
 
 		 225 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  34.9 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  37.25 
 
 		 221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  34.33 
 
 		 202 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  33.65 
 
 		 220 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  33.98 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  34.13 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  32.38 
 
 		 318 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  34.85 
 
 		 256 aa  105  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  32.5 
 
 		 219 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  32 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  31.73 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  31.52 
 
 		 219 aa  99.8  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  33.89 
 
 		 201 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  31.79 
 
 		 222 aa  98.6  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  31.79 
 
 		 222 aa  98.6  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  30.81 
 
 		 209 aa  98.2  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  28.71 
 
 		 200 aa  98.2  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  35.39 
 
 		 225 aa  97.1  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  31.22 
 
 		 211 aa  96.3  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  30 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  31.12 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  33.89 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  33.01 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  31.12 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  31.12 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  29.81 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  32.12 
 
 		 225 aa  95.5  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  31.73 
 
 		 207 aa  95.1  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  30.89 
 
 		 221 aa  95.1  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  31.73 
 
 		 207 aa  95.1  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  31.73 
 
 		 207 aa  95.1  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  31.73 
 
 		 207 aa  95.1  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  32.54 
 
 		 207 aa  94.7  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  30.39 
 
 		 223 aa  94.7  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  30.61 
 
 		 205 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  30.3 
 
 		 223 aa  94.4  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  32.54 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  32.54 
 
 		 207 aa  94.7  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  35 
 
 		 202 aa  94.4  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  30.29 
 
 		 206 aa  94.4  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  29.5 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  32.54 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  49.43 
 
 		 105 aa  94  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  32.32 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  32.32 
 
 		 196 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  32.76 
 
 		 209 aa  92.8  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  32.77 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  32.12 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 206 aa  92  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  33.14 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  36.2 
 
 		 223 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  32.52 
 
 		 220 aa  91.7  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  32.12 
 
 		 242 aa  92  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  34.27 
 
 		 224 aa  91.7  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2395  cytochrome c family protein  30.88 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.510701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  31.63 
 
 		 198 aa  91.3  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  31.41 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  31.52 
 
 		 226 aa  90.5  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  32.93 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  31.75 
 
 		 254 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  32.45 
 
 		 227 aa  89.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  33.71 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  33.54 
 
 		 219 aa  89.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  30.77 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  31.75 
 
 		 254 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  31.38 
 
 		 237 aa  89.4  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  38.51 
 
 		 292 aa  89.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  31.74 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  35.76 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  35.76 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  34.83 
 
 		 208 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  34.83 
 
 		 208 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 229 aa  88.6  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  32.34 
 
 		 219 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  29.61 
 
 		 206 aa  88.2  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2656  cytochrome c, class I  31.76 
 
 		 213 aa  88.2  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.964453  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  29.72 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  34.27 
 
 		 208 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  34.27 
 
 		 208 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  32.67 
 
 		 215 aa  87.8  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  31.34 
 
 		 265 aa  87.8  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  33.33 
 
 		 243 aa  87.8  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  30.54 
 
 		 206 aa  87.8  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  32.39 
 
 		 208 aa  87.8  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  32.7 
 
 		 216 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3772  cytochrome c family protein  30.54 
 
 		 206 aa  87.8  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  30.54 
 
 		 206 aa  87.8  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  30.86 
 
 		 238 aa  87  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  33.13 
 
 		 218 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  33 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  31.19 
 
 		 243 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  30.77 
 
 		 205 aa  87  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>