More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2878 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  100 
 
 		 118 aa  235  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1839  50S ribosomal protein L17  65.81 
 
 		 116 aa  151  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.501315  normal  0.68282 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2590  50S ribosomal protein L17  54.37 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000445959  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  62.07 
 
 		 162 aa  133  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  55.93 
 
 		 143 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  58.62 
 
 		 170 aa  130  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  57.63 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  57.63 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  57.63 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 127 aa  127  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 127 aa  127  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  56.78 
 
 		 127 aa  127  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  54.24 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 127 aa  127  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  57.63 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 127 aa  127  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 127 aa  127  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 127 aa  127  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 127 aa  127  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  58.47 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 128 aa  127  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 127 aa  127  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  58.47 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 139 aa  126  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1738  50S ribosomal protein L17  59.48 
 
 		 133 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  53.39 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  52.54 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  58.18 
 
 		 113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  56.78 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  57.63 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  55.08 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  53.39 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  53.39 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  53.39 
 
 		 142 aa  124  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2038  ribosomal protein L17  53.39 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0128526  hitchhiker  0.000448232 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  52.54 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  53.39 
 
 		 139 aa  124  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  53.39 
 
 		 178 aa  123  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3498  ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110108  hitchhiker  0.0000306031 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  56.78 
 
 		 131 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2615  ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718134  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1506  ribosomal protein L17  55.08 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952918 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  54.24 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  54.24 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  53.39 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5044  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0106  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.188563 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  52.54 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  54.95 
 
 		 114 aa  121  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 		 138 aa  121  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  56.78 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  49.15 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  56.41 
 
 		 130 aa  120  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  52.54 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 138 aa  120  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3922  ribosomal protein L17  55.93 
 
 		 132 aa  120  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>