More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1941 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1941  ribosomal protein L13  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1536  50S ribosomal protein L13  65.49 
 
 		 146 aa  194  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000633501  normal  0.222947 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1734  50S ribosomal protein L13  64.54 
 
 		 147 aa  170  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0413621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 149 aa  167  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  63.43 
 
 		 146 aa  167  7e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1941  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.62792e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  57.35 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0252  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000674786  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  57.78 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  54.86 
 
 		 151 aa  163  5.9999999999999996e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  56.62 
 
 		 143 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  58.52 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  58.52 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  55.8 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0801  50S ribosomal protein L13  53.33 
 
 		 151 aa  163  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  56.3 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  54.81 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  54.81 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0561  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000199102  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  56.3 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  56.3 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  55.97 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  159  9e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  56.3 
 
 		 142 aa  159  9e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  159  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  159  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  159  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  54.86 
 
 		 145 aa  159  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  54.23 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  54.86 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 163 aa  158  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  54.81 
 
 		 148 aa  158  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 154 aa  157  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  157  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  158  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  52.59 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  54.93 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 146 aa  157  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  157  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 144 aa  157  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  54.23 
 
 		 146 aa  157  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  51.75 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 145 aa  156  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 145 aa  156  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 145 aa  156  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 145 aa  156  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 145 aa  156  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 145 aa  156  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  54.17 
 
 		 145 aa  156  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 147 aa  156  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  55.07 
 
 		 143 aa  156  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000578919  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  53.68 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  53.68 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 149 aa  155  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 144 aa  155  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  53.33 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>