102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0057 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 126 aa  249  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0602  DNA binding domain protein, excisionase family  43.75 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  47.92 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  40 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  51.02 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  53.06 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  47.73 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0665  excisionase/Xis, DNA-binding  41.54 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.950953  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  47.92 
 
 		 180 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  47.92 
 
 		 180 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  47.92 
 
 		 180 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  44.9 
 
 		 56 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15570  hypothetical protein  42 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000408648  unclonable  2.14199e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2531  phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  hitchhiker  0.000129846 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4598  DNA binding domain protein, excisionase family  48 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  37.04 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  37.74 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0279  DNA binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908043  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  37.04 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  29.47 
 
 		 320 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  39.22 
 
 		 69 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  43.75 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1200  excisionase/Xis, DNA-binding  32.84 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00000791415  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  34.62 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 74 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0085  DNA binding domain-containing protein  40.43 
 
 		 73 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0754203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1182  phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.592067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4254  phage transcriptional regulator, AlpA  41.67 
 
 		 62 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631275  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  36 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  38 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1062  DNA binding domain protein, excisionase family  36.62 
 
 		 291 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1001  DNA-binding excisionase/Xis  44.68 
 
 		 290 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  39.22 
 
 		 69 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  38 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  34.62 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  40 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 90 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  34.62 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1575  DNA binding domain-containing protein  44.68 
 
 		 293 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.410844  hitchhiker  0.00561125 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1059  DNA binding domain protein, excisionase family  44.68 
 
 		 292 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  38 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  36 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  42.31 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  39.13 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3209  DNA binding domain protein, excisionase family  44.74 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  36 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0630  DNA binding domain protein, excisionase family  42.55 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1172  phage transcriptional regulator, AlpA  40.43 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  27.73 
 
 		 676 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  32.1 
 
 		 305 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6047  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  40.82 
 
 		 380 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  35.85 
 
 		 308 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2286  DNA binding domain-containing protein  40.43 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4125  MerR family regulatory protein  40.91 
 
 		 51 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1346  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000136372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1359  hypothetical protein  34.33 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.303648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  52.78 
 
 		 315 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  52.78 
 
 		 306 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  41.3 
 
 		 315 aa  42.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  50 
 
 		 315 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  52.78 
 
 		 306 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  50 
 
 		 315 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  52.78 
 
 		 306 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  34.04 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0048  DNA binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 296 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7292  DNA binding domain-containing protein  34.69 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137944  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1683  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.629523  decreased coverage  0.0000560234 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  50 
 
 		 306 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  52.78 
 
 		 306 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  52.78 
 
 		 306 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  34.04 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  35.71 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  36.96 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  35.19 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1079  DNA-binding protein/PTS system, IIA component  47.37 
 
 		 201 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01990  DNA-binding protein, excisionase family  27.27 
 
 		 315 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000725149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01890  DNA-binding protein, excisionase family  38 
 
 		 321 aa  42  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0766202 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3430  putative transcriptional regulator  36.21 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  37.25 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2438  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 291 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  30.51 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 		 306 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1410  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  37.04 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.251698  normal  0.111999 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0363  hypothetical protein  32.88 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1862  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382901  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  33.9 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0333  DNA binding domain protein, excisionase family  41.67 
 
 		 296 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102766 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  33.33 
 
 		 83 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2701  DNA binding domain-containing protein  34.69 
 
 		 111 aa  40  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>