162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0333 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0333  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
296 aa  584  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0048  DNA binding domain-containing protein  63.33 
 
 
296 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3033  excisionase/Xis, DNA-binding  45.45 
 
 
304 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.627333  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0629  periplasmic substrate-binding protein  44.59 
 
 
290 aa  216  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2745  DNA binding domain-containing protein  41.89 
 
 
300 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2438  DNA binding domain-containing protein  40.14 
 
 
291 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5502  DNA binding domain-containing protein  36.73 
 
 
291 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0194  DNA binding domain-containing protein  35.06 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.741486  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0369  DNA binding domain-containing protein  30.36 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000403691  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1908  excisionase/Xis, DNA-binding  32.9 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0119  excisionase/Xis, DNA-binding  31.37 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2264  DNA binding domain protein, excisionase family  33.03 
 
 
328 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0674  molybdate-binding domain-containing protein  29.77 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.95042e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4144  DNA binding domain-containing protein  28.76 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4502  hypothetical protein  29.7 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  26.09 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  26.09 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3620  hypothetical protein  29.57 
 
 
302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  26 
 
 
306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4428  DNA binding domain-containing protein  29.32 
 
 
301 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0344  DNA binding domain-containing protein  29.37 
 
 
301 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433328  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4820  DNA binding domain-containing protein  28.66 
 
 
301 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3784  DNA binding domain-containing protein  29.37 
 
 
301 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000134193  normal  0.867769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3909  DNA binding domain-containing protein  29.04 
 
 
301 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007474  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3713  DNA binding domain-containing protein  29.04 
 
 
301 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.017295  normal  0.392744 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4129  DNA binding domain-containing protein  29.04 
 
 
301 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000950861  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4099  DNA binding domain-containing protein  29.04 
 
 
301 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00105408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0240  DNA binding domain protein, excisionase family  29.04 
 
 
301 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.256207  hitchhiker  0.000155098 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4217  DNA binding domain-containing protein  29.04 
 
 
301 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00203903  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  26.09 
 
 
315 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  25.42 
 
 
306 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  26.67 
 
 
320 aa  106  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0684  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  28.62 
 
 
648 aa  105  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  25.75 
 
 
315 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  25.75 
 
 
306 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  25.75 
 
 
306 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  25.75 
 
 
306 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  25.42 
 
 
315 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24590  molybdenum cofactor synthesis domain protein  32.68 
 
 
645 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0052  DNA binding domain-containing protein  28.67 
 
 
301 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3717  DNA binding domain protein, excisionase family  33.89 
 
 
307 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.222458  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  24.92 
 
 
305 aa  99.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1861  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  32.76 
 
 
647 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.72567 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1453  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  33.48 
 
 
652 aa  95.9  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3228  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  31.2 
 
 
666 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1164  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  30.48 
 
 
655 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811833  hitchhiker  0.00369459 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1676  molybdenum cofactor synthesis domain protein  24.77 
 
 
633 aa  93.6  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4561  DNA binding domain protein, excisionase family  25.69 
 
 
335 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000373649  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0552  molybdate metabolism transcriptional regulator  33.9 
 
 
373 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  26.16 
 
 
308 aa  92.8  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1894  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  28.95 
 
 
640 aa  92.4  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.116253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0019  DNA binding domain protein, excisionase family  25.85 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0615  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  29.36 
 
 
651 aa  90.1  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0664  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  27.07 
 
 
621 aa  89.7  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.509419  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0447  molybdenum cofactor synthesis domain protein  29.59 
 
 
642 aa  89.7  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.583292  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  26.13 
 
 
317 aa  89  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3840  molybdate metabolism transcriptional regulator  31.55 
 
 
361 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335089  normal  0.579265 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2110  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  29.24 
 
 
649 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0934426 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0405  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  29.49 
 
 
636 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1772  molybdenum cofactor synthesis domain protein  30 
 
 
649 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1757  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.1 
 
 
371 aa  85.9  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3707  periplasmic-binding protein  32.43 
 
 
361 aa  85.9  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.775197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0730  molybdate metabolism transcriptional regulator  31.84 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.739883 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.27 
 
 
639 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1821  putative molybdate-binding protein  24.24 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0382  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  28.94 
 
 
650 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.690457  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0616  molybdate metabolism transcriptional regulator  32.07 
 
 
365 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2878  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  28.96 
 
 
644 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  23.96 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0374  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  29.07 
 
 
632 aa  83.6  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.858069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1059  DNA binding domain protein, excisionase family  30.72 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3020  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  30.6 
 
 
359 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475131  normal  0.0124041 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1062  DNA binding domain protein, excisionase family  31.21 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1625  molybdate transport repressor  31.91 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0967  molybdate metabolism transcriptional regulator  31.15 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930984  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0339  molybdate metabolism transcriptional regulator  29.51 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  25.89 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01990  DNA-binding protein, excisionase family  26.43 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000725149  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1391  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  24.45 
 
 
635 aa  79  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1822  molybdate metabolism transcriptional regulator  31.03 
 
 
386 aa  79  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00250223 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1797  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  29.64 
 
 
655 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.984095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0154  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  29.41 
 
 
627 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0854923 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1508  molybdate metabolism transcriptional regulator  32.16 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3952  DNA binding domain-containing protein  26.77 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  30.61 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  28.18 
 
 
376 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0985  putative molybdopterin biosynthesis protein MoeA/LysR substrate binding-domain-containing protein  27.27 
 
 
644 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.587268  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0555  molybdate metabolism transcriptional regulator  31.89 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1034  molybdate metabolism transcriptional regulator  31.89 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  27.22 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1919  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  31.76 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360263  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1001  DNA-binding excisionase/Xis  29.39 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2870  molybdate metabolism transcriptional regulator  31.66 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2092  hypothetical protein  31.2 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2243  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  31.33 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.963081  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1575  DNA binding domain-containing protein  30.03 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.410844  hitchhiker  0.00561125 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0993  molybdate metabolism transcriptional regulator  31.35 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0233787  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1577  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  35.96 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2363  molybdate metabolism transcriptional regulator  31.35 
 
 
368 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3016  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  29.51 
 
 
370 aa  72.4  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>