More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1879 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1879  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 362 aa  729    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  46.35 
 
 		 365 aa  306  3e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  41.46 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0467  hypothetical protein  44.54 
 
 		 352 aa  270  4e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.548776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  40.22 
 
 		 360 aa  248  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2526  ABC transporter related  36.57 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00407865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1695  ABC transporter related protein  36.11 
 
 		 366 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3542  ABC transporter related  35.46 
 
 		 365 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  40.6 
 
 		 240 aa  205  9e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  44.68 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  46.83 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  36.24 
 
 		 347 aa  185  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0069  ABC transporter related  35.49 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.675568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  36.53 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0301  ABC transporter related  32.05 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  40.51 
 
 		 243 aa  182  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  31.58 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  31.11 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  33.33 
 
 		 356 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  38.49 
 
 		 342 aa  179  7e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  33.43 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  33.22 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  39.33 
 
 		 244 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  37.92 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  36.59 
 
 		 372 aa  176  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1233  ABC transporter related  40.65 
 
 		 340 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  31.87 
 
 		 354 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.06 
 
 		 380 aa  176  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.16 
 
 		 354 aa  176  8e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0015  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  37.93 
 
 		 365 aa  175  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1331  ABC transporter related  32.11 
 
 		 348 aa  175  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0148601 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.31 
 
 		 357 aa  175  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  31.01 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  34.24 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  32.7 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  34.06 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  37.39 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  37.39 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  33.52 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2170  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.13 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.051022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0892  ABC transporter related  32.77 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.319827  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  41.34 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0754  ABC transporter related  35.28 
 
 		 363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3452  ABC transporter related  38.55 
 
 		 254 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  37.31 
 
 		 361 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  33.33 
 
 		 362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  35.21 
 
 		 366 aa  172  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1075  methionine import ATP-binding protein MetN  37.8 
 
 		 318 aa  173  5e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0097  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 341 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2452  phosphate transporter ATP-binding protein  38.62 
 
 		 272 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.98 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1233  methionine import ATP-binding protein MetN  35.92 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  33.86 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.15 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.9 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  33.9 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  31.46 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.37 
 
 		 378 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  34.48 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  33.79 
 
 		 363 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  36.96 
 
 		 373 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1790  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  37.4 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530432  decreased coverage  0.00975681 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0560  ABC-type phosphate transport system, ATPase component  37.96 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.23 
 
 		 386 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  34.68 
 
 		 373 aa  169  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2367  ABC transporter related  39.66 
 
 		 252 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1021  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  36.89 
 
 		 265 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.51 
 
 		 341 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  32.46 
 
 		 345 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1849  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.46 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5592  ABC transporter related  34.8 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  38.91 
 
 		 244 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0445  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  40.56 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  37.82 
 
 		 363 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1050  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  36.89 
 
 		 265 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  hitchhiker  0.000000448659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.84 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  37.3 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  37.11 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  40.65 
 
 		 346 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.81 
 
 		 369 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  39.17 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1314  ABC transporter related  34.05 
 
 		 373 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0580714 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  36.13 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2055  ABC transporter related  37.96 
 
 		 250 aa  168  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.351163  normal  0.0720953 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  35.81 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  35.15 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  35.07 
 
 		 361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  31.77 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  31.94 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  35.44 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  35.34 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  37.39 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  36.97 
 
 		 244 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0477  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.74 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.56 
 
 		 348 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  36.72 
 
 		 339 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6541  ABC transporter related  34.13 
 
 		 359 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131089 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1059  hypothetical protein  37.92 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.74 
 
 		 335 aa  166  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  36.05 
 
 		 364 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>