32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0091 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0091  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1272  hypothetical protein  44.34 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.708188  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0760  transcriptional regulator, ArsR family  35.09 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.357604  normal  0.170766 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0375  hypothetical protein  32.55 
 
 		 273 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.191948  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1756  regulatory protein, ArsR  37.93 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2068  transcriptional regulator, TrmB  36.17 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0660  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2193  hypothetical protein  33.94 
 
 		 252 aa  87  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.135571  normal  0.236804 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0340  regulatory protein, Crp  35.62 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.659624  normal  0.909155 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2080  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  28.57 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2012  ArsR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2162  regulatory protein, ArsR  30.85 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0234  ArsR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0654  hypothetical protein  27.52 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.997113  normal  0.803696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0650  hypothetical protein  28.19 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0231  ArsR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 277 aa  72  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3377  hypothetical protein  25.36 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000923215  hitchhiker  0.00992163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1189  regulatory protein, ArsR  29.93 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.581479  decreased coverage  0.00502087 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0583  transcriptional regulator, ArsR family  26.77 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3371  hypothetical protein  24.66 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00157866  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3361  hypothetical protein  22.51 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000089037  normal  0.0139562 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1817  hypothetical protein  24.07 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.081876  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1326  transcriptional regulator TrmB  26.5 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000018018 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1830  hypothetical protein  26.17 
 
 		 244 aa  52.4  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000650312  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  25.15 
 
 		 485 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1061  regulatory protein ArsR  24.84 
 
 		 385 aa  47.8  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.701357  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1726  transcriptional regulator, ArsR family  27.21 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0364777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2910  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 		 200 aa  45.4  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0348  transcriptional regulator, ArsR family  29.09 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.122504 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1509  transcriptional regulator, TrmB  33.93 
 
 		 292 aa  43.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.363784  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0605  hypothetical protein  27.52 
 
 		 208 aa  42.7  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0840  conserved hypothetical protein-like protein  29.01 
 
 		 205 aa  42  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>