60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2913 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2913  LmbE family protein  100 
 
 		 253 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.821813  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2686  LmbE family protein  95.65 
 
 		 253 aa  488  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2808  LmbE family protein  86.56 
 
 		 253 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3591  LmbE family protein  66.93 
 
 		 252 aa  310  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.00215841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2284  LmbE family protein  67.9 
 
 		 254 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0970807  normal  0.047773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1018  LmbE family protein  52.42 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3426  LmbE family protein  50 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00141665  normal  0.0279283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0082  LmbE family protein  33.77 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3052  LmbE family protein  33.77 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237793 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3367  hypothetical protein  36.78 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0232623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3974  LmbE family protein  27.97 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1416  LmbE family protein  28.39 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.993291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1021  LmbE-like protein protein  33.7 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0809018  hitchhiker  0.000000427707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7414  LmbE family protein  31.95 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  32.89 
 
 		 231 aa  53.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  24.23 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0889  LmbE family protein  34.62 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000133747  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_873  hypothetical protein  33.65 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209898  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1001  hypothetical protein  34.62 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000144261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  24.32 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  24.32 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  24.32 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  24.32 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  27.96 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  24.32 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  24.32 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  23.94 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2070  LmbE family protein  30.37 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229324  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  30.77 
 
 		 271 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  31.95 
 
 		 274 aa  49.3  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1295  LmbE family protein  35.23 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.566146 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  22.28 
 
 		 193 aa  49.3  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2231  hypothetical protein  28.49 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.64 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.64 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  27.64 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.64 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3428  LmbE family protein  34.09 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0528866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3561  conserved hypothetical protein LmbE  31.29 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1145  LmbE family protein  35.56 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4220  conserved hypothetical protein LmbE  29.22 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270991  hitchhiker  0.000751351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5995  LmbE family protein  27.33 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.220645 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  23.08 
 
 		 234 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  29.49 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.14 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  23.08 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0838  LmbE family protein  25.63 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1195  LmbE family protein  28.89 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2070  hypothetical protein  29.05 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1275  LmbE family protein  25.62 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.634359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  24.67 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  26.44 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4725  LmbE family protein  29.38 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0749271 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  21.68 
 
 		 207 aa  43.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4580  LmbE family protein  28.48 
 
 		 228 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2182  hypothetical protein  28.09 
 
 		 233 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3813  LmbE family protein  31.48 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4890  LmbE family protein  31.48 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0748012 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0264  LmbE family protein  37.04 
 
 		 240 aa  42.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0328102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  22.31 
 
 		 234 aa  42.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>