More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0070 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0070  amino acid transporter  100 
 
 		 279 aa  550  1e-156  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.462473  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0278  amino acid permease-associated region  45.65 
 
 		 434 aa  219  3.9999999999999997e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1136  amino acid permease-associated region  41.45 
 
 		 447 aa  202  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  41.24 
 
 		 433 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1315  amino acid permease-associated region  37.13 
 
 		 441 aa  163  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.172576  normal  0.0920117 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0803  amino acid transporter  43.75 
 
 		 429 aa  161  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00437  predicted transporter  35.32 
 
 		 430 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3124  amino acid permease-associated region  35.32 
 
 		 430 aa  142  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0565  amino acid permease family protein  35.32 
 
 		 430 aa  142  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00442  hypothetical protein  35.32 
 
 		 430 aa  142  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3130  amino acid permease-associated region  35.32 
 
 		 430 aa  142  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  hitchhiker  0.000108674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0579  amino acid permease family protein  35.32 
 
 		 430 aa  142  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0525  amino acid permease family protein  35.32 
 
 		 430 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0421  amino acid permease family protein  35.32 
 
 		 430 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0529  amino acid permease family protein  35.87 
 
 		 430 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0717  amino acid permease-associated region  32.37 
 
 		 434 aa  135  5e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1735  amino acid permease-associated region  28.74 
 
 		 452 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51734  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2678  amino acid permease-associated region  31.84 
 
 		 420 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0723531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2694  amino acid permease-associated region  31.84 
 
 		 450 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0425419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2649  amino acid permease-associated region  31.84 
 
 		 450 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1932  amino acid transporter  31.86 
 
 		 437 aa  94.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.392371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2108  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 		 445 aa  94  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1908  amino acid permease-associated region  31.51 
 
 		 440 aa  92.8  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00117224  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1272  amino acid permease-associated region  28.45 
 
 		 431 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0129  amino acid permease-associated region  27.92 
 
 		 451 aa  86.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1066  amino acid permease-associated region  38.66 
 
 		 425 aa  85.9  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  29.03 
 
 		 471 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  30.09 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  31.22 
 
 		 473 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0181  amino acid permease-associated region  31.05 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  28.04 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  28.04 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  28.04 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  28.94 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  29.49 
 
 		 471 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  29.49 
 
 		 471 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  28.64 
 
 		 471 aa  79  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  28.64 
 
 		 471 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3942  amino acid permease-associated region  32.87 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  27.96 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3604  amino acid permease-associated region  32.87 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466276 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  30.05 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  30.05 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  30.05 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  30.05 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  30.05 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  30.05 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  30.05 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  27.75 
 
 		 518 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  28.85 
 
 		 471 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  28.85 
 
 		 471 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  29.59 
 
 		 510 aa  75.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 476 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  31.18 
 
 		 467 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  30.73 
 
 		 770 aa  75.5  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3585  amino acid permease-associated region  30.56 
 
 		 764 aa  75.5  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  31.18 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  31.18 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  31.18 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  31.18 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  31.18 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  29.94 
 
 		 520 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  31.18 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1741  amino acid permease-associated region  28.48 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.908164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  30.3 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  30.3 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  31.18 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  29.88 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  27.1 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  25.76 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  27.57 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 		 488 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  32.59 
 
 		 515 aa  72.4  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  26.89 
 
 		 471 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  26.42 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  27.36 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  33.33 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  27.91 
 
 		 486 aa  71.2  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  28.04 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1784  amino acid transporter  26.29 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000562371  hitchhiker  4.50262e-17 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  28.18 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  24.83 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  26.07 
 
 		 495 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 471 aa  69.3  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  25.88 
 
 		 481 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  26.58 
 
 		 489 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  30.6 
 
 		 496 aa  68.9  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  28.9 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 549 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  26.73 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0241  amino acid permease  25.19 
 
 		 543 aa  68.2  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  30.26 
 
 		 471 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 764 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1009  amino acid permease-associated region  27.24 
 
 		 506 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0973  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 651 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650044 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1866  amino acid permease-associated region  29.81 
 
 		 458 aa  67  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  27.65 
 
 		 476 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  27.36 
 
 		 476 aa  66.6  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>