More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0535 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  100 
 
 		 238 aa  480  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  75.32 
 
 		 236 aa  380  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  70.71 
 
 		 239 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  73.22 
 
 		 239 aa  354  6.999999999999999e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  65.83 
 
 		 240 aa  341  5.999999999999999e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.33391 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  59.75 
 
 		 237 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  59.15 
 
 		 236 aa  290  2e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  57.98 
 
 		 238 aa  287  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  55.51 
 
 		 240 aa  281  7.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  54.02 
 
 		 242 aa  262  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  54.05 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  53.39 
 
 		 240 aa  257  9e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  53.15 
 
 		 240 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  51.67 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  51.88 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  51.46 
 
 		 240 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  51.05 
 
 		 240 aa  245  4e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  51.05 
 
 		 240 aa  241  5e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  46.06 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  49.34 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  42.62 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  44.73 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  43.51 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  40.59 
 
 		 238 aa  179  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  39.26 
 
 		 248 aa  179  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  43.51 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  39.68 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  39.92 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  41.35 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  40.49 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.71 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  39.51 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  39.61 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  39.61 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  39.52 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1295  50S ribosomal protein L2  41.04 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000231184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  37.86 
 
 		 287 aa  130  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  40.86 
 
 		 280 aa  129  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  41.08 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  40.98 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  36.59 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2420  50S ribosomal protein L2  39.29 
 
 		 264 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  37.62 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  39.77 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  37.38 
 
 		 287 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  37.86 
 
 		 275 aa  125  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  37.07 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  37.07 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  37.07 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  37.07 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  37.56 
 
 		 276 aa  124  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  35.89 
 
 		 279 aa  124  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  42.94 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4318  ribosomal protein L2  42.19 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  39.36 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  36.1 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  37.5 
 
 		 276 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  36.1 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  36.14 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  38.69 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  39.18 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0292  50S ribosomal protein L2  39.29 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  40 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  40 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  41.11 
 
 		 276 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  36.67 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  42.22 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  37.86 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  39.36 
 
 		 277 aa  123  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  36.2 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  39.36 
 
 		 277 aa  123  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  37.62 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2226  50S ribosomal protein L2  39.29 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000549007  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  41.24 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  40.56 
 
 		 276 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  40.56 
 
 		 276 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  40.56 
 
 		 276 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  40.56 
 
 		 276 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  40.56 
 
 		 276 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  40.56 
 
 		 276 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  40.56 
 
 		 276 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  35.82 
 
 		 277 aa  122  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  35.61 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  39.18 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  39.18 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  39.18 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  39.18 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  39.18 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  39.18 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  39.18 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  39.18 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  39.18 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  39.18 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  39.18 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  39.18 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  39.63 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0630  ribosomal protein L2  42.57 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  39.18 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  39.18 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  39.77 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>