More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1945 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  100 
 
 
442 aa  896    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  57.24 
 
 
418 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  49.54 
 
 
412 aa  388  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  49.09 
 
 
412 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  49.09 
 
 
411 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  48.85 
 
 
417 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0401  cytochrome P450  45.1 
 
 
421 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  47.94 
 
 
413 aa  362  8e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  47.83 
 
 
413 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5420  cytochrome P450  46.73 
 
 
468 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  46.59 
 
 
417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  38.28 
 
 
407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  38.28 
 
 
407 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  38.28 
 
 
407 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  39.44 
 
 
405 aa  268  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  37.35 
 
 
398 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  35.97 
 
 
419 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  36.32 
 
 
429 aa  239  6.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  36 
 
 
410 aa  239  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  34.26 
 
 
412 aa  233  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  35.04 
 
 
401 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  34.01 
 
 
411 aa  226  8e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  34.12 
 
 
402 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  33.5 
 
 
411 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  34.25 
 
 
427 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.99 
 
 
411 aa  220  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  39.8 
 
 
411 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  33.25 
 
 
411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  33.25 
 
 
411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  33.5 
 
 
411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.83 
 
 
411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  39.46 
 
 
411 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  39.46 
 
 
411 aa  219  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  33.92 
 
 
411 aa  219  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  33.57 
 
 
411 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  33.49 
 
 
405 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.47 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.09 
 
 
426 aa  216  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  34.86 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  33.03 
 
 
423 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  34.65 
 
 
402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  35.06 
 
 
409 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  34.57 
 
 
412 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  33.11 
 
 
404 aa  209  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  34.66 
 
 
406 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  35.42 
 
 
410 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  33.33 
 
 
409 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  32.92 
 
 
417 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  33.96 
 
 
416 aa  206  8e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  35.07 
 
 
417 aa  206  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  33.18 
 
 
400 aa  206  9e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  33.99 
 
 
407 aa  206  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  33.33 
 
 
399 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  33.58 
 
 
402 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  33.74 
 
 
388 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  34.41 
 
 
406 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  39.02 
 
 
414 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  30.16 
 
 
422 aa  203  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  39.51 
 
 
430 aa  203  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  34.29 
 
 
419 aa  203  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  34.25 
 
 
405 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  32.62 
 
 
402 aa  202  9e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  32.72 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  37.41 
 
 
409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  29.51 
 
 
420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  34.47 
 
 
404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  32.42 
 
 
408 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  33.57 
 
 
411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  32.38 
 
 
402 aa  199  6e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  32.7 
 
 
405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  37.11 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  32.68 
 
 
417 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  35.28 
 
 
409 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  38.85 
 
 
410 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  31.87 
 
 
423 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  33.26 
 
 
410 aa  196  8.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  33.99 
 
 
406 aa  196  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  38.73 
 
 
417 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  34.88 
 
 
411 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  33.18 
 
 
399 aa  194  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  32.61 
 
 
398 aa  193  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  33.16 
 
 
418 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  36.36 
 
 
400 aa  193  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  31.26 
 
 
407 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  33.18 
 
 
401 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  37.11 
 
 
407 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  32.54 
 
 
400 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  38.96 
 
 
414 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  33.95 
 
 
408 aa  190  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  40.78 
 
 
406 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  33.44 
 
 
411 aa  189  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  33.49 
 
 
414 aa  189  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  34.29 
 
 
406 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  34.29 
 
 
406 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  32.23 
 
 
399 aa  189  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  34.29 
 
 
406 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  34.9 
 
 
402 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  38.83 
 
 
414 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  36.13 
 
 
419 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  31.28 
 
 
380 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>