47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1743 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  87.73 
 
 
631 aa  943    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  100 
 
 
926 aa  1813    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1864  hypothetical protein  48.91 
 
 
656 aa  238  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.935351  normal  0.282908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2198  hypothetical protein  49.67 
 
 
747 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0450097  normal  0.656514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2108  hypothetical protein  48.34 
 
 
373 aa  151  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  45.12 
 
 
940 aa  146  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1797  hypothetical protein  46.5 
 
 
405 aa  145  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.000000000782574  normal 
 
 
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  46.71 
 
 
771 aa  139  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  47.37 
 
 
1096 aa  137  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  45.75 
 
 
586 aa  132  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  40.48 
 
 
861 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  43.67 
 
 
635 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  39.75 
 
 
525 aa  110  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1644  hypothetical protein  37.09 
 
 
416 aa  105  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0125  hypothetical protein  39.1 
 
 
418 aa  105  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2006  hypothetical protein  34.9 
 
 
435 aa  88.2  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  32.06 
 
 
656 aa  87.8  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  30.97 
 
 
1021 aa  82.4  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  23.4 
 
 
5743 aa  81.6  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.22 
 
 
6885 aa  80.9  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  29.52 
 
 
1213 aa  77.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  29.88 
 
 
2528 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  31.64 
 
 
1091 aa  72.4  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  27.47 
 
 
2552 aa  71.2  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  30.77 
 
 
1351 aa  64.7  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2171  hypothetical protein  22.28 
 
 
1879 aa  63.9  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  27.65 
 
 
1085 aa  63.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  33.64 
 
 
1279 aa  62.4  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4098  hypothetical protein  24.69 
 
 
1064 aa  61.2  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2544  APHP domain protein  32.35 
 
 
405 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  26.34 
 
 
1200 aa  58.9  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  30.57 
 
 
1311 aa  57  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.02 
 
 
1454 aa  56.2  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  27.49 
 
 
1951 aa  55.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  30.56 
 
 
857 aa  55.1  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  30 
 
 
1328 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  36.76 
 
 
1783 aa  52.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.3 
 
 
1448 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1345  hypothetical protein  21.82 
 
 
3121 aa  52  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3064  hypothetical protein  45 
 
 
168 aa  51.6  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187552  normal  0.503908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1936  APHP domain protein  25.55 
 
 
1074 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620471  normal  0.229187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  26.02 
 
 
1067 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  31.52 
 
 
1361 aa  49.7  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  29.06 
 
 
797 aa  49.7  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1462  APHP domain protein  33.87 
 
 
1378 aa  47.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  32.88 
 
 
882 aa  46.2  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3913  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.34 
 
 
1710 aa  44.3  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>