More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0576 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
292 aa  595  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  76.71 
 
 
292 aa  472  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  69.34 
 
 
289 aa  428  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  70.14 
 
 
297 aa  427  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  67.01 
 
 
347 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  66.67 
 
 
288 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  67.6 
 
 
297 aa  413  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  64.44 
 
 
303 aa  394  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  57.59 
 
 
297 aa  349  3e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  55.97 
 
 
293 aa  335  7e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  56.1 
 
 
299 aa  333  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  57.93 
 
 
292 aa  332  4e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  55.33 
 
 
299 aa  331  8e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  55.67 
 
 
299 aa  330  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  55.67 
 
 
299 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  55.67 
 
 
299 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  55.67 
 
 
299 aa  330  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  55.67 
 
 
299 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  54.27 
 
 
299 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  55.67 
 
 
299 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  55.67 
 
 
299 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  55.33 
 
 
299 aa  329  3e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  55.67 
 
 
299 aa  329  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  54.67 
 
 
292 aa  328  5.0000000000000004e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  57.6 
 
 
287 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  54.64 
 
 
299 aa  326  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  56.54 
 
 
287 aa  325  7e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  54.67 
 
 
293 aa  323  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  53.63 
 
 
293 aa  323  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  53.08 
 
 
299 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  56.18 
 
 
287 aa  322  6e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  52.9 
 
 
298 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  52.9 
 
 
298 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  52.9 
 
 
298 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  52.9 
 
 
298 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  52.9 
 
 
298 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  52.9 
 
 
298 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  52.9 
 
 
298 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  52.9 
 
 
298 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  52.9 
 
 
298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  53.24 
 
 
298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  54.01 
 
 
286 aa  320  3e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  53.98 
 
 
291 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  54.36 
 
 
286 aa  316  2e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  52.6 
 
 
290 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  53.61 
 
 
293 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  51.89 
 
 
295 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  51.05 
 
 
295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  50.7 
 
 
288 aa  296  3e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  51.4 
 
 
288 aa  292  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  50.18 
 
 
288 aa  276  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  45.58 
 
 
282 aa  255  7e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  42.96 
 
 
311 aa  229  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  43.77 
 
 
306 aa  228  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  42.16 
 
 
319 aa  225  9e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  44.86 
 
 
307 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  41.99 
 
 
306 aa  221  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  42.96 
 
 
307 aa  219  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  42.21 
 
 
302 aa  217  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  42.47 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  43.51 
 
 
308 aa  216  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  42.5 
 
 
306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  41.18 
 
 
305 aa  215  8e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  38.49 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  41.84 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  41.11 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  41.49 
 
 
307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  41.99 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  42.27 
 
 
298 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  41.64 
 
 
304 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  41.46 
 
 
308 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  40.56 
 
 
307 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  43.06 
 
 
308 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  39.5 
 
 
308 aa  211  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  40.28 
 
 
306 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  42.25 
 
 
307 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  40.56 
 
 
306 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  43.06 
 
 
308 aa  209  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  41.75 
 
 
307 aa  209  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  41.49 
 
 
309 aa  208  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  39.86 
 
 
312 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 
308 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 
308 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  42.11 
 
 
307 aa  207  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  39.5 
 
 
307 aa  207  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 
308 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  41.07 
 
 
306 aa  207  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  41.84 
 
 
308 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  41.99 
 
 
308 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  40.42 
 
 
307 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  40.57 
 
 
307 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 
308 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  40.97 
 
 
309 aa  206  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  41.3 
 
 
307 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  40.69 
 
 
307 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  40.57 
 
 
306 aa  206  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  43.77 
 
 
312 aa  206  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  40.57 
 
 
307 aa  205  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  40.49 
 
 
312 aa  205  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>