More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0347 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0347  nitrogenase iron protein subunit NifH  100 
 
 
265 aa  527  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1038  nitrogenase iron protein subunit NifH  76.98 
 
 
264 aa  414  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1178  nitrogenase  60.75 
 
 
264 aa  335  2.9999999999999997e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  49.44 
 
 
272 aa  270  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  50.56 
 
 
280 aa  268  5e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  51.91 
 
 
275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1616  NifH/frxC-family protein  48.53 
 
 
276 aa  263  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  51.69 
 
 
284 aa  263  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  48.33 
 
 
324 aa  259  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  51.15 
 
 
272 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  50.75 
 
 
276 aa  259  4e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  47.21 
 
 
270 aa  259  4e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  46.47 
 
 
291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0165  nitrogenase iron protein subunit NifH  49.19 
 
 
268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  46.39 
 
 
278 aa  250  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  49.24 
 
 
276 aa  248  5e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  44.64 
 
 
292 aa  248  7e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  45.66 
 
 
273 aa  246  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  45.66 
 
 
273 aa  245  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  48.68 
 
 
273 aa  245  6e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4046  nitrogenase iron protein  47.91 
 
 
275 aa  245  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.316801  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  46.01 
 
 
291 aa  244  6.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1937  nitrogenase  52.19 
 
 
272 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.894359  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  45.08 
 
 
287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4247  nitrogenase iron protein subunit NifH  46.67 
 
 
296 aa  243  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.252394  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  46.1 
 
 
292 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  49.2 
 
 
251 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  46.07 
 
 
299 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  43.45 
 
 
289 aa  241  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  43.88 
 
 
292 aa  241  7e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  46.39 
 
 
290 aa  241  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  48.68 
 
 
276 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  45.45 
 
 
289 aa  241  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  44.24 
 
 
313 aa  241  9e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  47.53 
 
 
276 aa  240  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  46.01 
 
 
274 aa  240  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0658  nitrogenase reductase  48.68 
 
 
275 aa  240  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0493156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2120  nitrogenase iron protein  44.7 
 
 
299 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.109902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  45.98 
 
 
292 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1434  nitrogenase iron protein  48.51 
 
 
283 aa  240  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  46.06 
 
 
295 aa  240  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  47.35 
 
 
275 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  45.63 
 
 
296 aa  240  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  49 
 
 
274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  46.59 
 
 
288 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  46.59 
 
 
288 aa  239  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  43.42 
 
 
292 aa  238  5e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  45.15 
 
 
296 aa  238  5e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1803  nitrogenase reductase  48.68 
 
 
275 aa  238  8e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.736404  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  43.91 
 
 
289 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  47.55 
 
 
277 aa  238  9e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  46.39 
 
 
274 aa  238  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  44.57 
 
 
290 aa  238  1e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  48.21 
 
 
274 aa  237  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  45.49 
 
 
280 aa  236  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  45.45 
 
 
275 aa  236  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0098  nitrogenase reductase  47.55 
 
 
275 aa  236  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.380897  normal  0.0345089 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  46.18 
 
 
299 aa  236  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0065  nitrogenase reductase  47.92 
 
 
275 aa  236  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4054  nitrogenase iron protein subunit NifH  44.88 
 
 
324 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00458685  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0650  nitrogenase iron protein  47.81 
 
 
288 aa  235  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2145  nitrogenase iron protein  47.41 
 
 
289 aa  234  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.936237 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  45.08 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3855  nitrogenase iron protein  43.38 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1218  nitrogenase iron protein  46.61 
 
 
288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02660  vanadium nitrogenase iron protein  46.48 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  45.45 
 
 
275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  46.4 
 
 
296 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  44.74 
 
 
275 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1175  nitrogenase iron protein  47.81 
 
 
289 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  46.62 
 
 
275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  45.78 
 
 
297 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2074  nitrogenase iron protein  47.01 
 
 
289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  48.21 
 
 
274 aa  231  6e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  49 
 
 
274 aa  230  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0662  nitrogenase iron protein subunit NifH  46.61 
 
 
289 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.24324  normal  0.221237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  45.25 
 
 
293 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  49 
 
 
274 aa  231  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  47.37 
 
 
288 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2821  nitrogenase iron protein  45.82 
 
 
289 aa  229  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1623  nitrogenase reductase  44.7 
 
 
275 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2364  nitrogenase iron protein  45.39 
 
 
298 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  48.21 
 
 
274 aa  226  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3534  nitrogenase reductase  45.85 
 
 
299 aa  226  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332377  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1041  nitrogenase iron protein subunit NifH  48.58 
 
 
248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.343788  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  47.81 
 
 
274 aa  225  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1813  nitrogenase iron protein  44.32 
 
 
296 aa  224  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1785  nitrogenase iron protein  44.32 
 
 
296 aa  224  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  45.49 
 
 
290 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0969  nitrogenase reductase  45.45 
 
 
299 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1073  nitrogenase reductase  45.45 
 
 
299 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  43.45 
 
 
290 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4463  nitrogenase reductase  44.96 
 
 
300 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1465  nitrogenase reductase  43.12 
 
 
293 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375574  hitchhiker  0.00132251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5101  nitrogenase reductase  45.34 
 
 
298 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  41.85 
 
 
303 aa  222  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  41.85 
 
 
293 aa  222  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1570  nitrogenase reductase  44.57 
 
 
298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1430  nitrogenase reductase  42.75 
 
 
293 aa  221  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0229  nitrogenase reductase  42.75 
 
 
293 aa  221  8e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>