More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1124 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  100 
 
 
369 aa  764  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  69.02 
 
 
378 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  69.21 
 
 
379 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  67.66 
 
 
382 aa  535  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  66.67 
 
 
382 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  66.94 
 
 
382 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40320  hypothetical protein  67.4 
 
 
381 aa  528  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4604  hypothetical protein  67.21 
 
 
382 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1431  Crp/FNR family transcriptional regulator  70.17 
 
 
398 aa  531  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  67.95 
 
 
371 aa  522  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.60208e-10 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  65.31 
 
 
381 aa  516  1e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  2.14748e-11 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  65.04 
 
 
381 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  65.04 
 
 
381 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  65.04 
 
 
381 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.55307e-08 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  65.21 
 
 
375 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  63.89 
 
 
376 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2887  hypothetical protein  63.84 
 
 
366 aa  464  1e-130  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  58.84 
 
 
377 aa  454  1e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1905  radical SAM protein  60.33 
 
 
403 aa  453  1e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  58.06 
 
 
362 aa  451  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  57.92 
 
 
372 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0679  hypothetical protein  57.71 
 
 
409 aa  446  1e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0648  hypothetical protein  57.98 
 
 
413 aa  447  1e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  58.54 
 
 
382 aa  447  1e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3129  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  58.22 
 
 
380 aa  447  1e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  58.26 
 
 
382 aa  445  1e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  58.73 
 
 
365 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0620  hypothetical protein  55.65 
 
 
370 aa  444  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180215  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3393  radical SAM enzyme, Cfr family  58.7 
 
 
382 aa  440  1e-122  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  58.69 
 
 
364 aa  439  1e-122  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1716  radical SAM protein  58.15 
 
 
401 aa  435  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973881  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1148  radical SAM enzyme, Cfr family  58.61 
 
 
383 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  0.550837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1212  hypothetical protein  59.05 
 
 
383 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1780  hypothetical protein  58.15 
 
 
406 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  60.22 
 
 
384 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1056  radical SAM enzyme, Cfr family  58.33 
 
 
383 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0486076  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1657  radical SAM enzyme, Cfr family  56.79 
 
 
401 aa  430  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.33058  normal  0.466299 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2109  hypothetical protein  60.22 
 
 
384 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  55.89 
 
 
392 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1837  radical SAM protein  57.89 
 
 
378 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2230  radical SAM protein  57.89 
 
 
378 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2192  radical SAM protein  57.89 
 
 
378 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0838123  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2669  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.87 
 
 
384 aa  423  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1109  radical SAM protein  57.89 
 
 
378 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1752  radical SAM protein  57.34 
 
 
379 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0060  radical SAM protein  57.89 
 
 
378 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0447485  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1198  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.71 
 
 
365 aa  424  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.347563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2668  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.87 
 
 
384 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2801  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.87 
 
 
384 aa  423  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3612  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.02 
 
 
398 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1165  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.86 
 
 
372 aa  423  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665651  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6265  hypothetical protein  57.34 
 
 
379 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1814  radical SAM protein  57.34 
 
 
379 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1160  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.87 
 
 
384 aa  423  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0206768 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1838  radical SAM protein  57.34 
 
 
379 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.662917 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1115  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.18 
 
 
392 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1347  radical SAM protein  57.89 
 
 
378 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02409  predicted enzyme  57.87 
 
 
384 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3742  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.87 
 
 
384 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2740  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.78 
 
 
393 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2357  radical SAM protein  57.89 
 
 
378 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06113  radical SAM enzyme, Cfr family  55.8 
 
 
393 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.245547  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01053  radical SAM enzyme, Cfr family  55.8 
 
 
393 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184624  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02371  hypothetical protein  57.87 
 
 
384 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1255  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.74 
 
 
400 aa  421  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.87 
 
 
384 aa  423  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2232  radical SAM protein  57.34 
 
 
378 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.750735  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1151  radical SAM enzyme, Cfr family  57.87 
 
 
384 aa  423  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.390398  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1725  radical SAM protein  57.34 
 
 
379 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.246342 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5115  hypothetical protein  57.61 
 
 
379 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159423  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0900  hypothetical protein  58.42 
 
 
372 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2895  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.3 
 
 
388 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3008  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.34 
 
 
373 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00899057  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.37 
 
 
372 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1113  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.18 
 
 
373 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.686108  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.46 
 
 
373 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106958  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.02 
 
 
388 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3017  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.74 
 
 
419 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1336  radical SAM family enzyme  56.51 
 
 
370 aa  418  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1461  radical SAM protein  57.62 
 
 
378 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0453987  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2783  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.3 
 
 
388 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.355164  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2720  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.3 
 
 
388 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.564025  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2764  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.3 
 
 
388 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2677  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.3 
 
 
388 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1397  radical SAM protein  56.51 
 
 
370 aa  418  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.724249  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1422  radical SAM protein  57.53 
 
 
382 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12366  normal  0.0354941 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  54.92 
 
 
374 aa  415  1e-115  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.06 
 
 
373 aa  415  1e-115  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0888845  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0421  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.96 
 
 
398 aa  417  1e-115  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.662236  hitchhiker  0.00298691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1290  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.96 
 
 
398 aa  417  1e-115  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  58.09 
 
 
359 aa  416  1e-115  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1296  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.34 
 
 
373 aa  416  1e-115  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499019  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3151  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.06 
 
 
373 aa  417  1e-115  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00905599  hitchhiker  0.00812914 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  54.92 
 
 
383 aa  415  1e-115  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1225  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.65 
 
 
373 aa  416  1e-115  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.461537  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1183  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  55.96 
 
 
398 aa  417  1e-115  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.34 
 
 
373 aa  416  1e-115  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1370  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.06 
 
 
373 aa  417  1e-115  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3315  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.37 
 
 
373 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1226  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  54.06 
 
 
373 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.173043  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>