289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0548 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0548  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  301  3e-81  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  58.06 
 
 
155 aa  172  1e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 
159 aa  109  1e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 
159 aa  109  1e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  2.87275e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 
159 aa  108  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  2.24859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  37.04 
 
 
160 aa  107  8e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  37.11 
 
 
156 aa  106  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.14035e-07 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  36.02 
 
 
159 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.53536e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
177 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  36.02 
 
 
159 aa  102  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  8.81248e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  39.35 
 
 
154 aa  102  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  30.43 
 
 
159 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  37.27 
 
 
159 aa  100  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  38.79 
 
 
159 aa  100  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  7.43067e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  31.82 
 
 
153 aa  100  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.67091e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  29.87 
 
 
154 aa  100  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  39.13 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  31.82 
 
 
146 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  31.21 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  38.75 
 
 
159 aa  97.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  29.87 
 
 
154 aa  97.8  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.55884e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 
159 aa  97.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  36.42 
 
 
159 aa  97.4  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  7.42092e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  32.9 
 
 
145 aa  97.4  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  38.27 
 
 
160 aa  97.1  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  36.02 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  36.02 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  32.92 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  37.04 
 
 
159 aa  95.5  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  38.51 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  33.54 
 
 
160 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
167 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  27.22 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
167 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  31.06 
 
 
156 aa  94.4  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.09351e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  30.43 
 
 
166 aa  94  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  33.96 
 
 
165 aa  93.6  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  32.48 
 
 
157 aa  93.6  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  38.75 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  32.52 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  39.75 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  31.06 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  32.72 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  30.43 
 
 
162 aa  92  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  27.39 
 
 
153 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  29.3 
 
 
153 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  35.62 
 
 
155 aa  90.9  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.27948e-07  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  31.25 
 
 
159 aa  90.9  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  32.69 
 
 
150 aa  91.3  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  7.74135e-12 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  27.85 
 
 
156 aa  90.9  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  1.42803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  33.95 
 
 
159 aa  91.3  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  35.26 
 
 
155 aa  90.9  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  1.20768e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  28.3 
 
 
157 aa  90.1  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  27.39 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  28.3 
 
 
157 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  32.72 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.7339e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  30.43 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.73176e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  37.04 
 
 
159 aa  89.4  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  27.92 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  33.12 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  33.12 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  31.33 
 
 
159 aa  87.4  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  36.31 
 
 
157 aa  87  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  30.57 
 
 
158 aa  87  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  32.92 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  25.95 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  28.48 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  29.56 
 
 
155 aa  86.3  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  27.33 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  28.93 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  29.38 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  29.19 
 
 
155 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  31.65 
 
 
155 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  3.86318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  28.57 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.47821e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  27.5 
 
 
155 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  28.75 
 
 
155 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  27.5 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  27.5 
 
 
155 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  28.3 
 
 
155 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  29.56 
 
 
157 aa  84.3  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  27.95 
 
 
155 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  31.48 
 
 
159 aa  84  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  27.95 
 
 
155 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 
156 aa  84  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  26.71 
 
 
155 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 
156 aa  82.8  2e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  29.49 
 
 
155 aa  82.8  2e-15  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 
159 aa  81.6  3e-15  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2319  hypothetical protein  26.45 
 
 
145 aa  80.5  7e-15  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  34.16 
 
 
159 aa  80.5  8e-15  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  27.27 
 
 
153 aa  80.5  8e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  26.88 
 
 
155 aa  79.3  2e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  8.61677e-08 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0986  rRNA large subunit methyltransferase  28.93 
 
 
156 aa  79.3  2e-14  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>