189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00219 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  100 
 
 
139 aa  290  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  63.49 
 
 
135 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  52.94 
 
 
133 aa  150  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  48.78 
 
 
131 aa  142  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  54.31 
 
 
135 aa  142  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  52.59 
 
 
136 aa  137  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  52.59 
 
 
138 aa  137  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  52.54 
 
 
136 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  52.54 
 
 
136 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  48.06 
 
 
134 aa  136  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  51.72 
 
 
136 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  50.85 
 
 
136 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  50.85 
 
 
136 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  51.72 
 
 
136 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  50.86 
 
 
134 aa  134  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
134 aa  133  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  51.69 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 
134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  47.5 
 
 
129 aa  130  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 
136 aa  130  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  43.55 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  43.55 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  43.55 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  42.74 
 
 
135 aa  124  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 
133 aa  120  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  42.64 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  40.5 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 
143 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 
140 aa  103  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 
145 aa  100  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  36.72 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  29.66 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  28.81 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 
139 aa  62.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 
144 aa  62  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  27.91 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.37 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.46 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.46 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.46 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  27.05 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  24.19 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  28.57 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  24.39 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.78 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 
145 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  23.58 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.32 
 
 
138 aa  53.9  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  23.02 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  24.39 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  25.18 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1329  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.78089  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  25.9 
 
 
143 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  25.9 
 
 
143 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
159 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  25.9 
 
 
143 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  25.9 
 
 
143 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  25.9 
 
 
159 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  25.9 
 
 
143 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  25.9 
 
 
143 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  24.39 
 
 
151 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  22.95 
 
 
140 aa  50.8  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  25.62 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  27.69 
 
 
150 aa  50.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  23.97 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>