More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00062 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  100 
 
 		 334 aa  690    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  56.89 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0070  glycosyl transferase family protein  58.39 
 
 		 347 aa  361  9e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  56.67 
 
 		 347 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0102  glycosyl transferase family protein  57.76 
 
 		 350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000136303 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  56.67 
 
 		 347 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  57.45 
 
 		 359 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  56.06 
 
 		 347 aa  352  4e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4100  glycosyl transferase family protein  56.29 
 
 		 340 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240394 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3934  glycosyl transferase family protein  55.26 
 
 		 343 aa  352  7e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157476  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  56.06 
 
 		 354 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0111  glycosyl transferase family protein  54.95 
 
 		 359 aa  349  3e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  56.06 
 
 		 347 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0109  glycosyl transferase family protein  55.39 
 
 		 342 aa  348  5e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3896  glycosyl transferase family protein  56.29 
 
 		 340 aa  349  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3988  glycosyl transferase family protein  56.29 
 
 		 340 aa  348  5e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  55.39 
 
 		 347 aa  345  6e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  50.92 
 
 		 347 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0240  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  48.18 
 
 		 373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394656  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0183  glycosyl transferase  48.18 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151268  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0329  glycosyl transferase family protein  47.42 
 
 		 348 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2606  lipopolysaccharide biosynthesis protein  43.38 
 
 		 357 aa  288  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.21938  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00662  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase III  43.11 
 
 		 351 aa  286  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001811  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  43.08 
 
 		 340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2260  glycosyl transferase family protein  42.39 
 
 		 364 aa  262  6.999999999999999e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1695  glycosyl transferase family protein  41.62 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0849  glycosyl transferase family 9  40.43 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02452  heptosyl transferase, glycosyltransferase family 9 protein  42.15 
 
 		 340 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1293  glycosyl transferase family protein  39.38 
 
 		 350 aa  249  5e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0307  glycosyl transferase family 9  38.51 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1358  saccharide biosynthesis regulatory protein  39.08 
 
 		 350 aa  246  4e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2806  glycosyl transferase family protein  38.51 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629835 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2622  hypothetical protein  38.51 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2749  hypothetical protein  38.51 
 
 		 349 aa  222  7e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2105  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase  36.01 
 
 		 351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0081  heptosyltransferase family protein  36.01 
 
 		 351 aa  220  3e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0197496  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0016  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 		 357 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  29.5 
 
 		 779 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  26.17 
 
 		 348 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.17 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1212  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.76 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0333  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  26.76 
 
 		 390 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.801367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1907  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  26.76 
 
 		 390 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0818  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  26.76 
 
 		 390 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1203  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.57 
 
 		 390 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1050  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  26.76 
 
 		 390 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 347 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2713  lipopolysaccharide heptosyltransferase-1, putative  26.1 
 
 		 349 aa  97.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1363  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  26.41 
 
 		 394 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.824879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0377  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27 
 
 		 352 aa  96.3  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  26.26 
 
 		 354 aa  95.9  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.65 
 
 		 362 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0894  putative glycosyltransferase  38.46 
 
 		 334 aa  92.4  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.619626  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  26.39 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3922  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.46 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0304832  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4721  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2729  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637215  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4110  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.46 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0371925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3940  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.46 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.465225  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4048  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.46 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2334  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 		 392 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0453286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.74 
 
 		 339 aa  89.7  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0990  lipopolysaccharide core biosynthesis heptosyltransferase  26.22 
 
 		 458 aa  89.4  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.67 
 
 		 352 aa  89.4  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.53 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4003  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  24.1 
 
 		 356 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.043966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4091  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  26.64 
 
 		 361 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  23.86 
 
 		 370 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24 
 
 		 360 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 		 404 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  27.89 
 
 		 361 aa  86.3  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.5 
 
 		 332 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.5 
 
 		 332 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.25 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2715  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.08 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902664  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  22.94 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2614  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.4 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0965  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.11 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.33 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4375  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  23.16 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.26 
 
 		 361 aa  82.4  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.32 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2230  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2350  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 475 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  33.73 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  23.67 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0507  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4057  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.88 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245519  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.51 
 
 		 516 aa  79.7  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.51 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  23.65 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1796  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.77 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03441  hypothetical protein  21.51 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.331205  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.51 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.51 
 
 		 352 aa  79.3  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0642  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  25.57 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>