More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1014 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 279 aa  567  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  53.38 
 
 		 277 aa  285  5e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1376  phosphomethylpyrimidine kinase  51.72 
 
 		 266 aa  265  5e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1368  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  44.7 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 		 270 aa  245  6.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0143  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  43.94 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1782  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  43.07 
 
 		 278 aa  235  6e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000968277 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  45.63 
 
 		 268 aa  229  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  46.21 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  45.83 
 
 		 268 aa  225  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  46.36 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 		 265 aa  224  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1271  phosphomethylpyrimidine kinase  43.02 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000051939  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  42.58 
 
 		 260 aa  218  7e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  44.15 
 
 		 436 aa  218  8.999999999999998e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  42.08 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  46.39 
 
 		 264 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  43.51 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  44.66 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  41.35 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  45.14 
 
 		 273 aa  208  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  44.75 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  44.75 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  43.97 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  43.3 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 270 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 		 270 aa  205  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2130  phosphomethylpyrimidine kinase  42.48 
 
 		 276 aa  204  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00414672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2168  phosphomethylpyrimidine kinase  42.48 
 
 		 276 aa  204  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0225656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  41.15 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  41.73 
 
 		 270 aa  203  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  42.41 
 
 		 273 aa  204  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2346  phosphomethylpyrimidine kinase  45.53 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  40.53 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  41.54 
 
 		 270 aa  202  7e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  40.96 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  41.83 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  41.67 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  47.29 
 
 		 479 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  44.53 
 
 		 268 aa  200  3e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  43.08 
 
 		 269 aa  198  7.999999999999999e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  42.42 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  43.51 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  43.18 
 
 		 271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  41.42 
 
 		 268 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  38.7 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  41.63 
 
 		 264 aa  194  9e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 		 490 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  41.29 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  39.15 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  42.53 
 
 		 264 aa  192  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  41.56 
 
 		 497 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  39.15 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  39.23 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  38.22 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 		 288 aa  188  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  40.23 
 
 		 288 aa  188  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  40.74 
 
 		 484 aa  188  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2484  phosphomethylpyrimidine kinase  42.56 
 
 		 275 aa  188  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  38.22 
 
 		 270 aa  188  9e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  40.86 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  40.15 
 
 		 266 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  40.33 
 
 		 484 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  37.84 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0839  phosphomethylpyrimidine kinase  41.04 
 
 		 449 aa  186  5e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0554  phosphomethylpyrimidine kinase  39.47 
 
 		 282 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1848  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0564  phosphomethylpyrimidine kinase  39.47 
 
 		 282 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0576  phosphomethylpyrimidine kinase  39.47 
 
 		 282 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.409483  decreased coverage  0.00355637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  42.15 
 
 		 497 aa  185  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  40.56 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  46.92 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0240  phosphomethylpyrimidine kinase  41.42 
 
 		 449 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.180045 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  43.46 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  42.64 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  39.69 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  41.09 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  41 
 
 		 283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  40.7 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  39.47 
 
 		 269 aa  181  8.000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  41.03 
 
 		 492 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  41.89 
 
 		 272 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  38.61 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  38.52 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1419  phosphomethylpyrimidine kinase  39.55 
 
 		 450 aa  181  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.528826 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1932  phosphomethylpyrimidine kinase  46.09 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34590  phosphomethylpyrimidine kinase  36.33 
 
 		 268 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  41.38 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>