More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0037 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0037  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  827    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2050  peptide ABC transporter permease  41.63 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0199  peptide ABC transporter permease  40.21 
 
 		 369 aa  243  3e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0016  ABC transporter, permease protein  33.57 
 
 		 398 aa  200  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  31.07 
 
 		 402 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0189  hypothetical protein  32.27 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0184  hypothetical protein  32.27 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.430576  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  32.24 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  31.07 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  29.83 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  29.83 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  31.43 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  31.52 
 
 		 400 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  30.21 
 
 		 443 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  26.23 
 
 		 401 aa  156  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  30.64 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  29.53 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  29.13 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  30.7 
 
 		 656 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  28.95 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  28.88 
 
 		 400 aa  153  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  29.81 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  28.5 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  30.05 
 
 		 653 aa  150  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  29.79 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  28.88 
 
 		 401 aa  150  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1791  ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 		 394 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  29.74 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  29.84 
 
 		 406 aa  149  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2215  protein of unknown function DUF214  29.58 
 
 		 402 aa  149  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.556165  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7079  protein of unknown function DUF214  28.82 
 
 		 452 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  28.7 
 
 		 405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  27.96 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  30.19 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  29.81 
 
 		 401 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  28.03 
 
 		 405 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  29.81 
 
 		 401 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  28.21 
 
 		 391 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  28.44 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  29.58 
 
 		 657 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  30.68 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  27.39 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  30.27 
 
 		 643 aa  143  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  28.94 
 
 		 406 aa  143  6e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  29.45 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  28.61 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  27.67 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  28.34 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  28.64 
 
 		 405 aa  140  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  27.78 
 
 		 687 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  26.41 
 
 		 456 aa  139  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  30 
 
 		 648 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  27.79 
 
 		 681 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  27.79 
 
 		 681 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  30 
 
 		 648 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  29.13 
 
 		 644 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  29.19 
 
 		 647 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.59 
 
 		 653 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  27.74 
 
 		 653 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  28.22 
 
 		 653 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  28.61 
 
 		 658 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  28.22 
 
 		 653 aa  136  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  27.21 
 
 		 409 aa  136  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  28.4 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  28.47 
 
 		 656 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  27.4 
 
 		 696 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  28.15 
 
 		 647 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  29.53 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  29.57 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  29.5 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  30.7 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  27.15 
 
 		 406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  29.11 
 
 		 409 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  30.34 
 
 		 661 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  28.13 
 
 		 663 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  29.86 
 
 		 670 aa  133  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  25.77 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  27.84 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  28.87 
 
 		 650 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  27.92 
 
 		 663 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0476  ABC transporter, permease protein  29.06 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  26.78 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  27.12 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  27.12 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  27.7 
 
 		 409 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  28.4 
 
 		 391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.21 
 
 		 656 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  26.78 
 
 		 399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  29.1 
 
 		 383 aa  130  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  27.4 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  27.46 
 
 		 409 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  27.15 
 
 		 410 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  25.68 
 
 		 653 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  28.88 
 
 		 391 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  28.95 
 
 		 391 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 		 405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  27.12 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>