More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4039 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  59.28 
 
 
878 aa  831  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  59.42 
 
 
730 aa  862  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  68.48 
 
 
744 aa  949  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  59.5 
 
 
722 aa  841  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  60 
 
 
723 aa  867  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  59.83 
 
 
723 aa  845  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  53.61 
 
 
746 aa  726  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  68.49 
 
 
743 aa  995  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  54.06 
 
 
751 aa  772  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  59.15 
 
 
883 aa  814  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  59.64 
 
 
727 aa  842  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  65.84 
 
 
741 aa  951  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  68 
 
 
748 aa  934  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  59.01 
 
 
886 aa  830  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  59.01 
 
 
886 aa  830  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  50.76 
 
 
871 aa  687  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  72.45 
 
 
755 aa  1013  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  100 
 
 
727 aa  1442  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.02251e-09 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  52.26 
 
 
730 aa  751  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  41.15 
 
 
861 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  41.02 
 
 
861 aa  485  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  39.75 
 
 
856 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  40.03 
 
 
896 aa  478  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  40.65 
 
 
875 aa  475  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  35.94 
 
 
882 aa  468  1e-130  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  34.69 
 
 
894 aa  468  1e-130  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  38.35 
 
 
858 aa  459  1e-128  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  41.53 
 
 
855 aa  458  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  40.93 
 
 
862 aa  454  1e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  40 
 
 
865 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.42292e-09 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  38.55 
 
 
856 aa  447  1e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  36.19 
 
 
876 aa  447  1e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  40.87 
 
 
861 aa  445  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  40.08 
 
 
855 aa  442  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  36.58 
 
 
895 aa  440  1e-122  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  38.67 
 
 
856 aa  442  1e-122  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  37.79 
 
 
857 aa  441  1e-122  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  39.94 
 
 
879 aa  442  1e-122  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  37.78 
 
 
856 aa  440  1e-122  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  37 
 
 
894 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  40 
 
 
890 aa  439  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  38.15 
 
 
906 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  36.31 
 
 
902 aa  438  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  39.64 
 
 
855 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  36.18 
 
 
879 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  39.64 
 
 
855 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  35.5 
 
 
877 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  35.64 
 
 
877 aa  436  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  41.07 
 
 
872 aa  432  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  36.7 
 
 
885 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  38.44 
 
 
908 aa  429  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  37.35 
 
 
918 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  36.99 
 
 
901 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  38.61 
 
 
914 aa  418  1e-115  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  33.65 
 
 
893 aa  418  1e-115  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  39.61 
 
 
881 aa  413  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  37.22 
 
 
910 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  37.5 
 
 
900 aa  407  1e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  33.75 
 
 
887 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  35.65 
 
 
939 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  30.97 
 
 
874 aa  359  1e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  30.68 
 
 
874 aa  352  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  27.11 
 
 
622 aa  185  2e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  27.72 
 
 
637 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  27.91 
 
 
636 aa  177  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  28.12 
 
 
646 aa  166  2e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  33.08 
 
 
664 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.65 
 
 
778 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.33 
 
 
778 aa  152  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  26.9 
 
 
573 aa  149  1e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  29.45 
 
 
647 aa  147  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  28.35 
 
 
755 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.51 
 
 
755 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 
1103 aa  138  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1972  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  37.27 
 
 
594 aa  130  1e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0840229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  26.99 
 
 
1086 aa  125  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.18 
 
 
757 aa  126  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  32.52 
 
 
593 aa  124  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  32.73 
 
 
579 aa  123  1e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  32.43 
 
 
571 aa  123  1e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  35.96 
 
 
569 aa  122  2e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0815  glutathione synthase  32.32 
 
 
572 aa  121  5e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
588 aa  120  1e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  28.88 
 
 
328 aa  120  1e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  32.42 
 
 
581 aa  118  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1821  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.74 
 
 
750 aa  117  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0432982  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0217  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
588 aa  117  8e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  29.31 
 
 
578 aa  116  1e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  32.42 
 
 
585 aa  116  2e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  29.02 
 
 
593 aa  116  2e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0257  cyanophycin synthetase-like  28.96 
 
 
333 aa  116  2e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  6.01246e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1632  acetyltransferase, GNAT family  30.82 
 
 
582 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  30.21 
 
 
582 aa  115  4e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
581 aa  114  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
609 aa  114  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0274694  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  30 
 
 
597 aa  112  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  28.16 
 
 
754 aa  111  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  23.36 
 
 
441 aa  110  9e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3472  glutathione synthase  28.74 
 
 
328 aa  108  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.680273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  29.23 
 
 
584 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>