More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0534 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0534  transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  613  9.999999999999999e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.207932  hitchhiker  0.0000000000234574 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  42.26 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  42.55 
 
 		 235 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  41.7 
 
 		 235 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1339  GntR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.344054  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  41.28 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  39.83 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0510  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0480  GntR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00570822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  37.45 
 
 		 236 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  37.45 
 
 		 236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 236 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  36.6 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  36.17 
 
 		 236 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  36.17 
 
 		 236 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  36.17 
 
 		 236 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  36.17 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  36.17 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  36.17 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0510  trehalose operon repressor  34.6 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0497  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1334  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  decreased coverage  0.000248139 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2016  transcriptional regulator, GntR family  33.6 
 
 		 242 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.47195  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0603  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 239 aa  95.1  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.971454  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 243 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 238 aa  90.5  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 240 aa  89  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 233 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  27.11 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 		 241 aa  86.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 244 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 248 aa  86.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 248 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  29.78 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 248 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 		 238 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0342  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0407848  hitchhiker  0.000377769 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  25.53 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3593  transcriptional regulator, GntR family  28.09 
 
 		 239 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 244 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  25.43 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  25.43 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  31.51 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  25.43 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  25.43 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  25.43 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  26.67 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 235 aa  68.9  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  25 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1435  transcriptional regulator  26.5 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.851115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>