More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0603 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0603  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 239 aa  499  1e-140  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.971454  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1334  transcriptional regulator, GntR family  43.16 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  decreased coverage  0.000248139 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2016  transcriptional regulator, GntR family  37.87 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.47195  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1339  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.344054  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0510  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  32.77 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  31.91 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0480  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00570822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  31.49 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  32.34 
 
 		 236 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  32.34 
 
 		 236 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  32.34 
 
 		 236 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  32.34 
 
 		 236 aa  122  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 236 aa  121  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  31.49 
 
 		 236 aa  118  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  31.06 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  31.95 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  29.29 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  28.87 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0497  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0510  trehalose operon repressor  30.64 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0534  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 300 aa  95.1  9e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.207932  hitchhiker  0.0000000000234574 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 243 aa  88.6  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 238 aa  85.5  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  26.27 
 
 		 237 aa  85.1  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  23.43 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1883  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  25.73 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  26.57 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  25.11 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 243 aa  72  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  22.13 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  23.5 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  23.5 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  23.5 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  23.5 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  26.29 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0559  transcriptional regulator  24.37 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128597  hitchhiker  0.00000147754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  24.36 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  23.5 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  24.36 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  21.7 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  21.7 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  21.7 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  21.7 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  21.7 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  24.68 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  21.7 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  23.5 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  24.22 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  23.08 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  27.2 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  26.15 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  21.28 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2619  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  24.66 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  22.22 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  23.01 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  22.82 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0194  transcriptional regulator, GntR family  24.07 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000195939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  22.87 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  22.82 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  23.93 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0522  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  23.19 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0078  histidine utilization repressor  22.37 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  24.77 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>