More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1339 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1339  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  495  1e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.344054  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0510  GntR family transcriptional regulator  58.4 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0480  GntR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00570822  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0534  transcriptional regulator  41.42 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.207932  hitchhiker  0.0000000000234574 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  39.15 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  38.72 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  36.93 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  36.93 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 235 aa  148  8e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0603  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 239 aa  142  4e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.971454  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0497  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 242 aa  142  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0510  trehalose operon repressor  35.98 
 
 		 242 aa  142  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  34.45 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  34.45 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  34.45 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  34.45 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  34.45 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  34.45 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2016  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 242 aa  138  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.47195  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  34.03 
 
 		 236 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 236 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  33.61 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  33.61 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1334  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  decreased coverage  0.000248139 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 238 aa  99.8  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  26.45 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  26.89 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  24.28 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.69 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  24.28 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  24.89 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  24.28 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  24.28 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  24.28 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  24.28 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  28.81 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  24.89 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  23.87 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  24.02 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  25.33 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  25.33 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  26.05 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  24.02 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  28.26 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  24.54 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  24.9 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  28.86 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.767574 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2250  transcriptional regulator GntR  29.57 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.412993  normal  0.738616 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 238 aa  72  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  25.67 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  25.67 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  25.67 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2558  transcriptional regulator PhnF  28.41 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0194  transcriptional regulator, GntR family  25.85 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000195939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4635  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000503298  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  24.79 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  26.2 
 
 		 257 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0420  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.330179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0456  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20350  putative transcriptional regulator  28.15 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238526  normal  0.704224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4489  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.666836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.4 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.58 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  29.58 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  29.58 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  29.58 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  29.58 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  29.58 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4343  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  21.65 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  30.99 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  24.1 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>