More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0205 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  57.28 
 
 		 656 aa  757    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 		 660 aa  769    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  60.12 
 
 		 665 aa  811    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  59.32 
 
 		 648 aa  778    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  57.98 
 
 		 660 aa  770    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  57.98 
 
 		 660 aa  769    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 		 660 aa  768    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 654 aa  680    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 		 655 aa  688    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 657 aa  752    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  58.28 
 
 		 660 aa  771    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  57.49 
 
 		 660 aa  768    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 650 aa  674    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  57.98 
 
 		 660 aa  770    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  64.26 
 
 		 675 aa  871    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  56.79 
 
 		 650 aa  749    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  57.76 
 
 		 659 aa  762    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 		 653 aa  676    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  52.9 
 
 		 632 aa  678    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 645 aa  656    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 		 645 aa  655    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 657 aa  752    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  58.28 
 
 		 660 aa  776    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  58.45 
 
 		 666 aa  780    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  57.25 
 
 		 675 aa  790    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 681 aa  1401    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 		 702 aa  805    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 667 aa  808    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  57.98 
 
 		 660 aa  769    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  57.98 
 
 		 660 aa  778    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 645 aa  622  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 648 aa  617  1e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 653 aa  608  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 651 aa  601  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 664 aa  580  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 647 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 647 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 654 aa  566  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 650 aa  554  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  53.67 
 
 		 518 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 645 aa  555  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 533 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 638 aa  543  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 651 aa  543  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 634 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 512 aa  537  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 629 aa  538  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 516 aa  536  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 629 aa  538  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 638 aa  532  1e-150  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 628 aa  529  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 634 aa  519  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 644 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 671 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 642 aa  514  1e-144  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 629 aa  515  1e-144  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 636 aa  502  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 632 aa  497  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 510 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 509 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 508 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 509 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 642 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 511 aa  481  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 		 509 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 624 aa  479  1e-134  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 509 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 648 aa  474  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6468  methionyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 628 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 628 aa  472  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0855  methionyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 628 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.411642  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 511 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 		 506 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0486  methionyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 523 aa  465  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 514 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0035  methionyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 509 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 		 663 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 657 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 648 aa  456  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 636 aa  458  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 640 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 670 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2717  methionyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 722 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1583  methionyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 517 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 519 aa  455  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 515 aa  449  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 515 aa  451  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1462  methionyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 544 aa  451  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2681  methionyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 514 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2273  methionyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 519 aa  450  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000444544 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 515 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6921  methionyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 515 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276994  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1459  methionyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 500 aa  448  1.0000000000000001e-124  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 522 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0187  methionyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 521 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  44.15 
 
 		 574 aa  447  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2008  methionyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 659 aa  445  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838931  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4327  methionyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 550 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>