More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01410 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 
233 aa  460  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1502  Methyltransferase type 12  55.29 
 
 
223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  46.81 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  40.09 
 
 
225 aa  132  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1197  Methyltransferase type 12  37.55 
 
 
289 aa  126  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1258  hypothetical protein  43.75 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  36 
 
 
198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39 
 
 
200 aa  106  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  38.28 
 
 
220 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.18 
 
 
200 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  34.76 
 
 
211 aa  92  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  32.18 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  34.16 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  34.93 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  34.93 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  34.93 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 
204 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
341 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  29.09 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  29.09 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  29.09 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  29.09 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 
324 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  29.09 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  29.09 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  29.09 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  37.6 
 
 
327 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
328 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
328 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
328 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  35.66 
 
 
332 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
196 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  36.3 
 
 
320 aa  58.5  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  35 
 
 
205 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  35.17 
 
 
331 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  41.24 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
310 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  36.09 
 
 
204 aa  55.8  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.8 
 
 
233 aa  55.8  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  38.46 
 
 
267 aa  55.5  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
334 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 
236 aa  55.5  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
337 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  37.62 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  34.31 
 
 
447 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.58 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  36.5 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.58 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.61 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  41.67 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
255 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  35.95 
 
 
267 aa  53.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  36.79 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  34.11 
 
 
202 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.59 
 
 
374 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 
235 aa  53.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  35.78 
 
 
245 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  34.34 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
253 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 
244 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  27.54 
 
 
202 aa  52.8  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
333 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  27.1 
 
 
206 aa  52.8  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.11 
 
 
236 aa  52.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0847  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 
272 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.988937  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  29.57 
 
 
256 aa  52.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.19 
 
 
423 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
241 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  40.2 
 
 
329 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  42.16 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.21 
 
 
205 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  31.25 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  32.69 
 
 
267 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  32.5 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.36 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3415  Methyltransferase type 12  35.78 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428011  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  25.83 
 
 
400 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  29.17 
 
 
524 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  29.91 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  30.94 
 
 
192 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3694  Methyltransferase type 11  37 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00559242  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  33.1 
 
 
634 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5457  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 
385 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26285  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  36.8 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.8 
 
 
291 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  39 
 
 
295 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
335 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  40.91 
 
 
250 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
246 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  26.38 
 
 
199 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  36.8 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
285 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 
254 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.59 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4330  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.54 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.249898  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
317 aa  49.7  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>