101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0014 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
378 aa  720  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 
389 aa  146  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 
398 aa  132  7e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  32.75 
 
 
751 aa  118  1e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  33.14 
 
 
754 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  31.73 
 
 
741 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  36.09 
 
 
393 aa  79.3  9e-14  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  19.46 
 
 
397 aa  76.6  7e-13  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  35.58 
 
 
409 aa  74.7  2e-12  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  27.15 
 
 
394 aa  74.3  4e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
383 aa  73.2  7e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  8.82956e-09 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
390 aa  72.8  8e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
705 aa  71.6  2e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  28.19 
 
 
407 aa  71.6  2e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  25.27 
 
 
388 aa  70.5  4e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.32371e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  28.11 
 
 
443 aa  70.1  6e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
385 aa  70.1  6e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
397 aa  69.7  7e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
392 aa  69.3  1e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  25.66 
 
 
1293 aa  69.3  1e-10  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  33.8 
 
 
370 aa  68.6  2e-10  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  29.06 
 
 
394 aa  68.6  2e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  30.86 
 
 
405 aa  67.8  3e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  29.66 
 
 
1119 aa  67.4  4e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  24.84 
 
 
319 aa  67.4  4e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  28.42 
 
 
412 aa  66.6  7e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
397 aa  65.5  1e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  21.9 
 
 
385 aa  63.9  4e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  27.89 
 
 
420 aa  63.9  5e-09  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
416 aa  62.4  1e-08  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  35.06 
 
 
392 aa  61.6  2e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
382 aa  61.6  2e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  23.94 
 
 
374 aa  61.2  3e-08  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  35.06 
 
 
392 aa  61.2  3e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  28.76 
 
 
783 aa  60.1  7e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  34.42 
 
 
392 aa  58.9  1e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
422 aa  59.3  1e-07  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  26.3 
 
 
375 aa  58.9  2e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  30.84 
 
 
376 aa  58.2  2e-07  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  45.71 
 
 
903 aa  58.5  2e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  23.44 
 
 
411 aa  58.5  2e-07  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 
395 aa  57.8  3e-07  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.44 
 
 
411 aa  57.8  3e-07  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  34.91 
 
 
417 aa  57  5e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6507  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
383 aa  56.6  6e-07  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.961113  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  27.34 
 
 
783 aa  56.2  1e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
395 aa  55.5  2e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  9.81139e-08 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 
394 aa  54.7  2e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  34.18 
 
 
403 aa  54.7  3e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
403 aa  54.7  3e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  29.62 
 
 
372 aa  54.3  4e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
461 aa  53.9  5e-06  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
385 aa  53.9  5e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  34.94 
 
 
382 aa  53.9  5e-06  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  32.41 
 
 
814 aa  53.5  6e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  34.39 
 
 
400 aa  52.4  1e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08930  glycosyltransferase  32.4 
 
 
390 aa  52.8  1e-05  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
422 aa  52.4  1e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  38.05 
 
 
416 aa  51.6  2e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  35.09 
 
 
396 aa  52  2e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  43.75 
 
 
350 aa  51.6  2e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0421  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.14 
 
 
411 aa  51.2  3e-05  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0822776  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  26.48 
 
 
726 aa  50.8  4e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  21.49 
 
 
404 aa  50.8  4e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4290  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.33 
 
 
375 aa  50.4  5e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.937919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1931  hypothetical protein  27.72 
 
 
412 aa  50.4  5e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210708  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1298  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
374 aa  50.1  6e-05  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  31.76 
 
 
729 aa  49.7  8e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0364  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.86 
 
 
412 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  18.49 
 
 
427 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  18.49 
 
 
427 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3374  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0766435  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  23.05 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1825  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
353 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  24.04 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
728 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  29.92 
 
 
434 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
728 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 
386 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  31.47 
 
 
417 aa  47.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 
380 aa  47  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2483  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0486018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 
390 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  30.91 
 
 
443 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 
463 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 
417 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  19.58 
 
 
477 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  29.45 
 
 
564 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
378 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 
396 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  22.3 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  21.86 
 
 
331 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
405 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
399 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
575 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
390 aa  43.5  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.26 
 
 
403 aa  42.7  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>