226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1718 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  100 
 
 
429 aa  838    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  50.59 
 
 
421 aa  413  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  53.05 
 
 
424 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  52.23 
 
 
429 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  52.2 
 
 
418 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  51.71 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  51.71 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  48.13 
 
 
416 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  47.56 
 
 
426 aa  363  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  37.47 
 
 
397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  34.61 
 
 
428 aa  253  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  41.03 
 
 
443 aa  249  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  34.47 
 
 
427 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  34.64 
 
 
417 aa  226  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  34.02 
 
 
429 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  33.84 
 
 
410 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  34.38 
 
 
418 aa  212  9e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  34.38 
 
 
418 aa  212  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  35.14 
 
 
409 aa  207  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  35.16 
 
 
447 aa  204  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  34.5 
 
 
412 aa  204  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  34.77 
 
 
411 aa  202  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  35 
 
 
446 aa  200  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  30.53 
 
 
444 aa  199  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 
432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  31.09 
 
 
412 aa  195  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 
430 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  32.91 
 
 
411 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
436 aa  193  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 
432 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  30.73 
 
 
412 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  34.11 
 
 
415 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  30.57 
 
 
412 aa  188  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  28.61 
 
 
408 aa  188  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 
417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  32.66 
 
 
726 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  30.28 
 
 
411 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  32.46 
 
 
443 aa  179  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  31.57 
 
 
433 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  33.08 
 
 
420 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  32.11 
 
 
425 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  29.92 
 
 
404 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  30.33 
 
 
429 aa  176  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  32.03 
 
 
471 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  31.5 
 
 
433 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  31.99 
 
 
427 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  29.82 
 
 
713 aa  170  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  27.89 
 
 
471 aa  162  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  31.37 
 
 
427 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  28.17 
 
 
444 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  33.05 
 
 
412 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0101  major facilitator transporter  33.85 
 
 
426 aa  152  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  26.16 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  27.7 
 
 
436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  28.42 
 
 
412 aa  146  8.000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  28.03 
 
 
430 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  25.96 
 
 
459 aa  143  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  26.02 
 
 
444 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  26.02 
 
 
446 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  27.08 
 
 
520 aa  142  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  27.22 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  26.85 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  25.29 
 
 
474 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  27.11 
 
 
395 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  26.11 
 
 
481 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  25.17 
 
 
447 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  28.18 
 
 
474 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  28.09 
 
 
436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  27.06 
 
 
434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  25.84 
 
 
443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  27.45 
 
 
434 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 
480 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  25.87 
 
 
480 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  25.87 
 
 
480 aa  136  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  25.71 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  25.87 
 
 
480 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  27.86 
 
 
432 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  26.93 
 
 
438 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 
454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  27.11 
 
 
395 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  26.8 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  24.94 
 
 
474 aa  131  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  25.92 
 
 
473 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  26.39 
 
 
476 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  26.98 
 
 
465 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  26.04 
 
 
464 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  28.09 
 
 
414 aa  127  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  25.77 
 
 
476 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  24.94 
 
 
446 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  24.94 
 
 
446 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  24.94 
 
 
446 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0467  major facilitator transporter  27.06 
 
 
439 aa  124  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.677382 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 
418 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  25.6 
 
 
407 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
397 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  26.77 
 
 
421 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  25.95 
 
 
394 aa  106  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  27.1 
 
 
380 aa  100  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  27.44 
 
 
380 aa  100  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  26.07 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>