More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_22940 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  42.5 
 
 
242 aa  189  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  40.76 
 
 
243 aa  181  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  39.08 
 
 
247 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  36.33 
 
 
260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  38.4 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 
243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
239 aa  161  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
248 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
243 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
243 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
239 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
243 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
243 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  36.55 
 
 
246 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
255 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
240 aa  148  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 
246 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
241 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
241 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  35.93 
 
 
242 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 
245 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
266 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  36.64 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
258 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
256 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
256 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  33.2 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  35.02 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 
242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
242 aa  135  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
256 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  35.22 
 
 
256 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  29.88 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  33.2 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  35.83 
 
 
239 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 
252 aa  131  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
268 aa  131  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
244 aa  129  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  36.75 
 
 
241 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.22 
 
 
242 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  36.68 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 
244 aa  128  9.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
252 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
252 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
252 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
249 aa  126  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 
244 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  34.93 
 
 
239 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 
240 aa  125  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
232 aa  125  6e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
245 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
241 aa  125  9e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
257 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
257 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
240 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  38.31 
 
 
239 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 
242 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
256 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
248 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2418  putative transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 
247 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.04 
 
 
255 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 
246 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0724  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 
244 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  30.57 
 
 
240 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  30.57 
 
 
240 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 
240 aa  122  4e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 
254 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.57 
 
 
240 aa  122  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  31.88 
 
 
235 aa  122  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 
254 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.57 
 
 
240 aa  122  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
243 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.57 
 
 
240 aa  122  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  37.81 
 
 
239 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
236 aa  121  9e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  37.81 
 
 
239 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.57 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  30.47 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>