More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_19730 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1528  ABC transporter related  47.76 
 
 
246 aa  230  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0114  ABC transporter related  44.18 
 
 
258 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  45.27 
 
 
274 aa  224  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  42.97 
 
 
251 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1130  ABC transporter related  44.64 
 
 
258 aa  206  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  hitchhiker  0.000478037 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  41.7 
 
 
243 aa  205  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  41.46 
 
 
248 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  40.49 
 
 
243 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  40.41 
 
 
245 aa  199  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  40.24 
 
 
248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  39.84 
 
 
248 aa  198  7e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  39.84 
 
 
248 aa  198  7.999999999999999e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0768  ABC transporter related protein  39.67 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3195  ABC transporter related protein  38.67 
 
 
285 aa  195  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  43.84 
 
 
240 aa  195  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  40.16 
 
 
279 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48.37 
 
 
334 aa  192  6e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1675  ABC transporter related  41.67 
 
 
246 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  38.68 
 
 
241 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  43.06 
 
 
260 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  41.88 
 
 
338 aa  188  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  41.35 
 
 
293 aa  188  8e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  38.27 
 
 
244 aa  188  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  38.21 
 
 
251 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  37.86 
 
 
244 aa  187  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  38.62 
 
 
253 aa  187  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  36.63 
 
 
244 aa  185  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  36.21 
 
 
244 aa  185  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  40 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  37.29 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  38.4 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  37.66 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  37.92 
 
 
316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  41.3 
 
 
282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  38.19 
 
 
257 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  38.62 
 
 
260 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  36.21 
 
 
244 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  35.39 
 
 
244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0869  ABC transporter related  39.91 
 
 
305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.348691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  35.8 
 
 
244 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  41.05 
 
 
298 aa  179  4.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  35.8 
 
 
244 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  34.98 
 
 
244 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  34.98 
 
 
244 aa  178  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  39.15 
 
 
339 aa  178  9e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  40.09 
 
 
334 aa  178  9e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  34.98 
 
 
244 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1793  ABC transporter-like protein  41.86 
 
 
270 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  38.46 
 
 
334 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  42.73 
 
 
341 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  36.63 
 
 
259 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  34.98 
 
 
244 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  34.98 
 
 
244 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  42.03 
 
 
326 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  34.98 
 
 
244 aa  176  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  35.89 
 
 
337 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  40.91 
 
 
295 aa  176  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  39.39 
 
 
309 aa  175  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0667  ABC transporter related  43.95 
 
 
317 aa  175  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.747248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  34.57 
 
 
244 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  39.3 
 
 
332 aa  174  9e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  38.64 
 
 
318 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1791  ABC transporter-like protein  38.91 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  34.98 
 
 
244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  37.89 
 
 
339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  40.44 
 
 
314 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  37.78 
 
 
318 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  38.94 
 
 
316 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  35.32 
 
 
339 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4339  ABC-type transport system, ATPase component  39.45 
 
 
305 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037549  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3736  Na+ extrusion transport system ATP-binding protein  39.48 
 
 
249 aa  171  9e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  36.6 
 
 
320 aa  171  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  40.45 
 
 
244 aa  171  9e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  35.94 
 
 
578 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  35.94 
 
 
578 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  35.94 
 
 
578 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  35.94 
 
 
578 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
578 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0376  ABC transporter related  40.45 
 
 
244 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 
266 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 
578 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
578 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.57 
 
 
279 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  38.29 
 
 
339 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.94 
 
 
316 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  38.29 
 
 
339 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  36.8 
 
 
338 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  34.82 
 
 
250 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
578 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.7 
 
 
333 aa  170  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
578 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  35.37 
 
 
255 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.24 
 
 
317 aa  170  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  40.27 
 
 
250 aa  169  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  37.33 
 
 
318 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  35.2 
 
 
250 aa  169  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  35.98 
 
 
247 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  35.2 
 
 
250 aa  169  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  37.93 
 
 
308 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>