More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_13580 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  100 
 
 
446 aa  927    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  40.48 
 
 
428 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  39.86 
 
 
433 aa  301  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  37.87 
 
 
429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  39.66 
 
 
430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  36.38 
 
 
444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  36.18 
 
 
439 aa  281  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  36.6 
 
 
426 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  36.9 
 
 
428 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  35.65 
 
 
434 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  33.25 
 
 
428 aa  256  7e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  35.4 
 
 
444 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  32.06 
 
 
477 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  31.11 
 
 
449 aa  230  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  32.49 
 
 
471 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  32.49 
 
 
471 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  33.98 
 
 
448 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  30.57 
 
 
441 aa  223  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  32.34 
 
 
434 aa  224  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  34.92 
 
 
462 aa  223  8e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  35.25 
 
 
433 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
483 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
459 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  32.82 
 
 
445 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  30.2 
 
 
477 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  30.48 
 
 
486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  32 
 
 
490 aa  213  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.6 
 
 
471 aa  213  7e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  31.12 
 
 
471 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  33.08 
 
 
471 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.22 
 
 
479 aa  210  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.78 
 
 
478 aa  206  5e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  32.9 
 
 
470 aa  206  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  31.22 
 
 
475 aa  206  6e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  31.1 
 
 
480 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  32.73 
 
 
477 aa  202  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 
472 aa  200  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  32.12 
 
 
473 aa  196  6e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  32.33 
 
 
476 aa  196  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  31.3 
 
 
474 aa  192  7e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  30.88 
 
 
468 aa  192  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3555  Radical SAM domain protein  30.82 
 
 
448 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1163  Radical SAM domain protein  31.62 
 
 
444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0513  radical SAM domain-containing protein  32.6 
 
 
445 aa  190  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000241934  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1617  Radical SAM domain protein  29.54 
 
 
469 aa  189  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.61 
 
 
472 aa  187  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0919  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
422 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0931  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.24 
 
 
465 aa  187  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.988397  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  32.44 
 
 
493 aa  186  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1023  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 
467 aa  186  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1516  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 
469 aa  186  7e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0112694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  31.44 
 
 
512 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1644  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 
468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 
467 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0940  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.63 
 
 
461 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.481544 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  31.85 
 
 
502 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0200  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 
468 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0997671  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1318  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.64 
 
 
471 aa  182  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  31.94 
 
 
509 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3556  Radical SAM domain protein  32.95 
 
 
450 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3535  Radical SAM domain protein  31.38 
 
 
444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2731  Radical SAM domain protein  30.5 
 
 
465 aa  179  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  28.72 
 
 
520 aa  177  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 
600 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  31.02 
 
 
490 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0267  Radical SAM domain protein  29.2 
 
 
469 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626864  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1806  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 
468 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.18 
 
 
441 aa  169  7e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1537  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.77 
 
 
462 aa  169  9e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.537529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  29.1 
 
 
527 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  31.49 
 
 
498 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  31.28 
 
 
504 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  30.45 
 
 
504 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  31.75 
 
 
504 aa  168  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 
441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0407  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.11 
 
 
466 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201202  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 
500 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2757  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 
462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.61 
 
 
524 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  27.63 
 
 
501 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  29.97 
 
 
502 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1089  radical SAM family Fe-S protein  30.97 
 
 
591 aa  161  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.977516  normal  0.0200721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  30 
 
 
542 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  30.35 
 
 
523 aa  159  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  27.76 
 
 
524 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1975  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 
468 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00675749  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  29.01 
 
 
533 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 
522 aa  156  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 
451 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0116  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.84 
 
 
461 aa  155  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 
498 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  29.71 
 
 
503 aa  154  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  28.86 
 
 
529 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  31.13 
 
 
503 aa  153  5e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 
543 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 
459 aa  152  8.999999999999999e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  29.82 
 
 
503 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  27.76 
 
 
547 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  28.61 
 
 
533 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 
525 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.170027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>