More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0506 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  100 
 
 		 364 aa  738    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  48.74 
 
 		 376 aa  335  5.999999999999999e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  44.67 
 
 		 344 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  47.65 
 
 		 332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  43.12 
 
 		 331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  43.03 
 
 		 333 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  45.28 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  42.27 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  42.9 
 
 		 321 aa  286  5e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  39.32 
 
 		 332 aa  281  9e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  41.82 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  41.82 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  39.01 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  39.01 
 
 		 332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  39.01 
 
 		 332 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  39.01 
 
 		 332 aa  271  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  38.7 
 
 		 332 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  38.7 
 
 		 332 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  38.7 
 
 		 332 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  38.7 
 
 		 332 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  38.7 
 
 		 332 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  38.7 
 
 		 332 aa  269  4e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  42.17 
 
 		 354 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  43.41 
 
 		 388 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  42.43 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  42.56 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  40.13 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  41.23 
 
 		 333 aa  245  9e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  41.95 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  40.06 
 
 		 368 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  39.76 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  45.95 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  40.58 
 
 		 412 aa  239  6.999999999999999e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  41.72 
 
 		 324 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  41.53 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  41.99 
 
 		 361 aa  237  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  41.8 
 
 		 331 aa  236  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  40.84 
 
 		 341 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  41.03 
 
 		 374 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4597  biotin synthase  43.12 
 
 		 366 aa  232  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  40.19 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  42.29 
 
 		 353 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  42.32 
 
 		 345 aa  229  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  40.4 
 
 		 363 aa  229  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  40.52 
 
 		 349 aa  229  6e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  40.89 
 
 		 364 aa  229  8e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  41.48 
 
 		 331 aa  228  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  38.82 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  41.16 
 
 		 331 aa  227  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  41.2 
 
 		 331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  40.51 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  38.59 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  40.13 
 
 		 322 aa  219  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  38.59 
 
 		 334 aa  219  8.999999999999998e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  40.69 
 
 		 328 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  39.18 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  37.46 
 
 		 329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  40.84 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  40.84 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  40.84 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  34.81 
 
 		 326 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  39.55 
 
 		 332 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  39.03 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  43.75 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  37.7 
 
 		 334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  38.91 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  39.36 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  33.75 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  40.26 
 
 		 347 aa  212  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  38.73 
 
 		 327 aa  212  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  35.31 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  39.44 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  35.96 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  41.03 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  35.65 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0984  biotin synthase  40 
 
 		 337 aa  210  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265011 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  34.62 
 
 		 319 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  38.8 
 
 		 336 aa  209  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  40.34 
 
 		 361 aa  209  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  38.49 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  38.62 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  34.29 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0875  biotin synthase  39.87 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  35.24 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0967  biotin synthase  41.16 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00736488  normal  0.128814 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  36.28 
 
 		 350 aa  206  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  37.05 
 
 		 352 aa  206  7e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  33.75 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  37.94 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  36.93 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  37.46 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  37.94 
 
 		 328 aa  204  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  35.96 
 
 		 320 aa  202  9e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2187  biotin synthase  36.67 
 
 		 367 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.80903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  37.3 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  36.66 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  36.33 
 
 		 360 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  37.82 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  36.13 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  32.92 
 
 		 333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>