157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2398 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 
326 aa  652    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  41.06 
 
 
323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  31.85 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  32.57 
 
 
339 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  35.11 
 
 
354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  33.86 
 
 
341 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  28.39 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  29.85 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 
311 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  25.83 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  32.72 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  29.95 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  29.95 
 
 
363 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  31.22 
 
 
367 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  25.85 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  30.61 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  32.69 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  30.61 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  27.3 
 
 
348 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  29.72 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  34.23 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  31.03 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  25.15 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  27.24 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  27.24 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0191  cytochrome oxidase assembly  23.17 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  35.21 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  25.52 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0681  cytochrome c assembly family protein  25.3 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.33629  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  25.3 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3189  cytochrome c assembly family protein  25.3 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  25.3 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  25.3 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  25.3 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  28.88 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0553  cytochrome oxidase assembly  25.38 
 
 
369 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241728  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  27.95 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  25.13 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  25.13 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  25.61 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  27.39 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  29.33 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4163  putative cytochrome oxidase assembly protein  26.15 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  25.61 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  28.71 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  30.68 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  30.68 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  30.68 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  30.06 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  30.68 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  28.42 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3900  cytochrome oxidase assembly  29.8 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.733003  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0043  putative cytochrome oxidase assembly protein  28.78 
 
 
394 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.484274  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1780  cytochrome oxidase assembly  26.6 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  24.52 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1778  hypothetical protein  26.11 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  28.28 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  33.59 
 
 
359 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0118  cytochrome oxidase assembly  24.17 
 
 
327 aa  63.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  28.42 
 
 
311 aa  63.2  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  25.8 
 
 
308 aa  62.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4613  cytochrome oxidase assembly protein, putative  28.57 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0072  cytochrome oxidase assembly  31.78 
 
 
359 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0609  putative cytochrome c oxidase assembly protein  35.25 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.868245  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  27.85 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  25.17 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0230  cytochrome oxidase assembly protein  26.85 
 
 
353 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00422033  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  32.06 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  27.88 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2895  cytochrome oxidase assembly  29.29 
 
 
370 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  24.75 
 
 
351 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0712  cytochrome oxidase assembly protein  34.29 
 
 
387 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.809899  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2755  cytochrome oxidase assembly  31.25 
 
 
370 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886693  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  26.9 
 
 
287 aa  60.1  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0629  putative cytochrome oxidase assembly protein  34.29 
 
 
387 aa  60.1  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  30 
 
 
345 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  26.35 
 
 
326 aa  59.7  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0465  cytochrome oxidase assembly  31.25 
 
 
370 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1753  putative cytochrome c oxidase assembly protein  30.17 
 
 
327 aa  59.3  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1045  cytochrome oxidase assembly  32.81 
 
 
356 aa  59.3  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  25.39 
 
 
337 aa  59.7  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3788  cytochrome oxidase assembly  22.56 
 
 
325 aa  59.3  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0124  cytochrome oxidase assembly  36.47 
 
 
359 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190927  normal  0.0274429 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  21.02 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  21.52 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0334  putative cytochrome aa3 oxidase assembly protein,related to CtaA  29.9 
 
 
327 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3490  cytochrome oxidase assembly  28.48 
 
 
327 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06441  hypothetical protein  29.07 
 
 
307 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0836643 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  24.76 
 
 
321 aa  58.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  23.78 
 
 
386 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0171  cytochrome oxidase assembly  28.25 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4119  cytochrome oxidase assembly  24.5 
 
 
325 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1228  cytochrome oxidase assembly  25.76 
 
 
367 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26943  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  26.53 
 
 
288 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04027  cytochrome oxidase assembly protein  34.29 
 
 
387 aa  57  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01360  hypothetical protein  29.93 
 
 
357 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0251  cytochrome oxidase assembly  25.9 
 
 
326 aa  56.6  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  24.04 
 
 
286 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0187  hypothetical protein  29.93 
 
 
357 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4187  cytochrome oxidase assembly  24.5 
 
 
325 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>