More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1696 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 201 aa  414  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  45.41 
 
 		 198 aa  158  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  48.63 
 
 		 193 aa  157  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  42.08 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.49 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 217 aa  131  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  42.71 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  36.76 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  39.04 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.63 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.5 
 
 		 190 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  36.36 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  36.61 
 
 		 189 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  36.36 
 
 		 194 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  39.56 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  36.9 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  37.11 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  36.26 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 378 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 		 440 aa  89  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  35.16 
 
 		 188 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  34.66 
 
 		 204 aa  88.2  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  39.52 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.67 
 
 		 378 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.15 
 
 		 427 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 222 aa  84.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  32.26 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.76 
 
 		 222 aa  84.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.65 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  35.79 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  34.03 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  39.1 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1008  phosphoglycerate mutase  34.2 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0974  phosphoglycerate mutase  34.2 
 
 		 243 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  39.72 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.84 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  39.72 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  36.21 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  30.61 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  32.5 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  44.55 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  33.12 
 
 		 438 aa  72.4  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.92 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 		 223 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  33.09 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3281  phosphoglycerate mutase  37.16 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  32.94 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  32.94 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  32.94 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0651  phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00089207  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  32.35 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  27.65 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  27.65 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.73 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.05 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  33.33 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.1 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2906  Phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.244907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  35.84 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  40.68 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.24 
 
 		 382 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.69 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>