More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3320 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  60.88 
 
 		 599 aa  660    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 587 aa  1173    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  60.85 
 
 		 601 aa  654    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  55.94 
 
 		 586 aa  607  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  41.14 
 
 		 577 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  36.82 
 
 		 566 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  36.97 
 
 		 573 aa  365  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  38.12 
 
 		 573 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  37.33 
 
 		 567 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  39.57 
 
 		 555 aa  355  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  34.31 
 
 		 570 aa  352  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  34.82 
 
 		 588 aa  345  1e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  36.28 
 
 		 557 aa  343  5.999999999999999e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  36.86 
 
 		 579 aa  343  7e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 		 588 aa  342  2e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  36.69 
 
 		 579 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  36.3 
 
 		 579 aa  341  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  36.3 
 
 		 579 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  36.69 
 
 		 579 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  36.69 
 
 		 579 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  36.69 
 
 		 579 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  36.52 
 
 		 583 aa  340  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  36.69 
 
 		 579 aa  340  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  36.52 
 
 		 583 aa  339  8e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  35.25 
 
 		 580 aa  339  8e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 		 588 aa  339  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  36.72 
 
 		 579 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  37.13 
 
 		 554 aa  335  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  36.09 
 
 		 565 aa  334  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  36.03 
 
 		 578 aa  333  5e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  34.86 
 
 		 562 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  35.41 
 
 		 559 aa  332  1e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  36.27 
 
 		 574 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  36.1 
 
 		 556 aa  325  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  36.21 
 
 		 560 aa  320  3.9999999999999996e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  30.92 
 
 		 565 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  32.42 
 
 		 574 aa  318  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  35.91 
 
 		 560 aa  317  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  31.09 
 
 		 565 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  34.32 
 
 		 556 aa  313  6.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  36.4 
 
 		 558 aa  311  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  35.25 
 
 		 558 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  33.84 
 
 		 561 aa  311  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  35.58 
 
 		 555 aa  310  5.9999999999999995e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  34.99 
 
 		 562 aa  310  6.999999999999999e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  35.86 
 
 		 560 aa  307  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  36.51 
 
 		 553 aa  308  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  36.74 
 
 		 553 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  35.92 
 
 		 572 aa  306  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  37.02 
 
 		 553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  34.24 
 
 		 572 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  33.73 
 
 		 565 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  32.88 
 
 		 558 aa  301  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  34.88 
 
 		 554 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  34.55 
 
 		 552 aa  300  4e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  36.96 
 
 		 556 aa  299  8e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  34.43 
 
 		 561 aa  299  1e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  35.47 
 
 		 563 aa  299  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  33.72 
 
 		 582 aa  297  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  36.82 
 
 		 564 aa  297  5e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  34.84 
 
 		 555 aa  296  8e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  34.49 
 
 		 553 aa  295  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 567 aa  294  4e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 559 aa  293  6e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 559 aa  293  6e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  34.75 
 
 		 567 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1612  DNA repair protein RecN  35.12 
 
 		 573 aa  291  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.458504 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 575 aa  289  9e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  33.61 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  33.79 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  33.79 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  32.01 
 
 		 574 aa  288  2e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  33.79 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  33.79 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  33.79 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  34.02 
 
 		 553 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  34.02 
 
 		 553 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  34.86 
 
 		 556 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  32.71 
 
 		 556 aa  286  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  34.02 
 
 		 553 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  34.02 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  34.02 
 
 		 553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  34.95 
 
 		 555 aa  285  2.0000000000000002e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  33.85 
 
 		 553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  32.77 
 
 		 553 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  33.85 
 
 		 553 aa  283  6.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 553 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  34.32 
 
 		 559 aa  282  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  33.56 
 
 		 553 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  33.62 
 
 		 553 aa  281  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  32.2 
 
 		 568 aa  280  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  33.62 
 
 		 553 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  33.5 
 
 		 569 aa  280  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  33.28 
 
 		 553 aa  279  9e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  30.3 
 
 		 551 aa  279  9e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  32.82 
 
 		 553 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  32.82 
 
 		 553 aa  279  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  32.82 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  36.27 
 
 		 572 aa  278  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  33.83 
 
 		 605 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>