More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0334 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0334  patatin  100 
 
 
279 aa  559  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  41.82 
 
 
327 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  36.9 
 
 
276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  38.87 
 
 
348 aa  149  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  34.77 
 
 
315 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  35.84 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  35.69 
 
 
323 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  38.16 
 
 
347 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  37.71 
 
 
343 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  36.33 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  37.41 
 
 
343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  34.01 
 
 
335 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  37.94 
 
 
390 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  34.77 
 
 
314 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  33.33 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  32.69 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  36.9 
 
 
327 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  36.4 
 
 
345 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  32.99 
 
 
300 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  31.87 
 
 
275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  33.33 
 
 
305 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  32.35 
 
 
292 aa  135  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15960  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  36.47 
 
 
276 aa  135  8e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  32.23 
 
 
263 aa  135  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  31.62 
 
 
292 aa  135  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  37.2 
 
 
320 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  31.5 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  32.01 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  33.88 
 
 
323 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  32.23 
 
 
263 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  43.35 
 
 
346 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  31.31 
 
 
303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  45.2 
 
 
368 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  43.35 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  31.11 
 
 
263 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  31.11 
 
 
263 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  31.11 
 
 
263 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  32 
 
 
354 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  37.04 
 
 
345 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  30.74 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  30.74 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0190  Patatin  31.91 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  30.74 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  32.08 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1656  Patatin  35.02 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.447346  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  41.9 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  30.37 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  32.53 
 
 
352 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  34.44 
 
 
348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  33.11 
 
 
322 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  30.77 
 
 
301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  34.31 
 
 
323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  47.75 
 
 
351 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0960823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  37.98 
 
 
728 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  32.18 
 
 
326 aa  128  9.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  30.77 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  42.46 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  30.24 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4236  patatin  41.9 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  33.97 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4392  patatin  41.9 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4170  patatin  41.9 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300364  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  38.33 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  31.95 
 
 
260 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  31.82 
 
 
321 aa  126  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  33.59 
 
 
320 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2623  patatin  32.89 
 
 
328 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0385483  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  34.15 
 
 
760 aa  126  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  32.84 
 
 
330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  33.21 
 
 
346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  34.88 
 
 
754 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  31.23 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  39.44 
 
 
257 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  30.61 
 
 
299 aa  125  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  35.16 
 
 
247 aa  125  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  30.61 
 
 
299 aa  125  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2451  patatin  32.66 
 
 
343 aa  125  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  34.78 
 
 
735 aa  125  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  47.19 
 
 
352 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  41.15 
 
 
738 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2204  hypothetical protein  33.7 
 
 
316 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  30.87 
 
 
312 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  38.76 
 
 
253 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3127  patatin  36.45 
 
 
344 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2995  patatin  41.99 
 
 
326 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  39.34 
 
 
737 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  31.38 
 
 
767 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  33.69 
 
 
803 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  41.38 
 
 
302 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  32.58 
 
 
737 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1917  Patatin  31.76 
 
 
267 aa  123  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4687  patatin  39.8 
 
 
333 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257253  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  41.48 
 
 
335 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  39.13 
 
 
738 aa  122  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  37.23 
 
 
327 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  32.9 
 
 
790 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  30.97 
 
 
324 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  33.33 
 
 
803 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  33.33 
 
 
803 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  31.91 
 
 
777 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>