86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1619 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1619  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
143 aa  281  1.0000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0146715  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0734  SNARE associated Golgi protein  40.88 
 
 
151 aa  115  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1089  SNARE associated Golgi protein  31.39 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  28.37 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0642  SNARE associated Golgi protein  30.88 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.7148  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  29.08 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  26.95 
 
 
160 aa  62  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0262  hypothetical protein  26.95 
 
 
157 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  26.95 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1342  SNARE associated Golgi protein  25.93 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  26.47 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2017  hypothetical protein  27.13 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0715199  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  34.26 
 
 
205 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2037  SNARE associated Golgi protein-like protein  32.37 
 
 
235 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  34.31 
 
 
203 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  30.07 
 
 
210 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  31.78 
 
 
207 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1381  membrane protein-like protein  25.74 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  31.78 
 
 
198 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  31.47 
 
 
195 aa  49.7  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0353  hypothetical protein  27.5 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2244  membrane protein-like protein  26.28 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0054372  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  29.13 
 
 
201 aa  49.3  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  31.63 
 
 
199 aa  48.9  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  30 
 
 
202 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.25 
 
 
206 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  31.47 
 
 
208 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2053  SNARE associated Golgi protein  26.53 
 
 
216 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  29.66 
 
 
200 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  28.46 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0030  membrane protein-like protein  25.19 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0561299  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  29.66 
 
 
212 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  27.86 
 
 
224 aa  47.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  31.5 
 
 
178 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  28.68 
 
 
236 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  30.07 
 
 
203 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0726  SNARE associated Golgi protein  32.79 
 
 
213 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  28.19 
 
 
202 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  31.63 
 
 
202 aa  45.4  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0213  hypothetical protein  25.16 
 
 
206 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.84 
 
 
201 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  32.35 
 
 
202 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  27.59 
 
 
210 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01067  membrane protein-like protein  24.39 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4281  hypothetical protein  22.7 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  25 
 
 
194 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  24.6 
 
 
143 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  29.23 
 
 
211 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 
212 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  31.68 
 
 
236 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  28.36 
 
 
214 aa  44.3  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  28.15 
 
 
416 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  29.2 
 
 
204 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  27.52 
 
 
202 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  28.43 
 
 
239 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2147  putative integral membrane protein  28.28 
 
 
139 aa  42.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.864762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  35.58 
 
 
212 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2487  hypothetical protein  21.9 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  25.76 
 
 
221 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  21.05 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  25.74 
 
 
249 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0039  SNARE associated Golgi protein  25.71 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.123227  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0687  DedA family protein, putative  27.54 
 
 
212 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00613405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3614  membrane protein-like protein  25.81 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0684  membrane protein-like protein  23.91 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  30.16 
 
 
218 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  25.96 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.68 
 
 
217 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2552  hypothetical protein  23.78 
 
 
144 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1716  membrane protein-like  24.29 
 
 
143 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  30.6 
 
 
219 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  25.33 
 
 
208 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0892  hypothetical protein  23.81 
 
 
160 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  22.73 
 
 
198 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5610  SNARE associated Golgi protein  23.93 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.407349 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1909  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.6 
 
 
250 aa  41.2  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000434207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  35.45 
 
 
206 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  28.24 
 
 
195 aa  41.2  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  26.4 
 
 
224 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  28.8 
 
 
218 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  28.8 
 
 
218 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0381  SNARE associated Golgi protein  25.87 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  17.76 
 
 
231 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  24.49 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3548  membrane protein-like protein  25 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  24.38 
 
 
222 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>