More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0052 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0052  ABC transporter, permease, sugar transport  100 
 
 		 332 aa  645    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0182601  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3651  monosaccharide-transporting ATPase  65.27 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163622  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0859  autoinducer AI-2 ABC transporter permease LsrC  64.97 
 
 		 351 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3522  autoinducer AI-2 ABC transporter, permease protein LsrC  65.17 
 
 		 351 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4406  inner membrane ABC transporter permease YdeY  62.99 
 
 		 347 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4321  inner membrane ABC transporter permease protein YdeY  62.99 
 
 		 347 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4474  inner membrane ABC transporter permease YdeY  62.69 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.629575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4404  inner membrane ABC transporter permease protein YdeY  62.99 
 
 		 347 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4291  inner membrane ABC transporter permease YdeY  63.06 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2132  Monosaccharide-transporting ATPase  65.12 
 
 		 342 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2144  monosaccharide-transporting ATPase  64.81 
 
 		 342 aa  374  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1596  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrC  64.81 
 
 		 342 aa  374  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1658  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrC  64.51 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2127  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrC  65.03 
 
 		 342 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3535  inner-membrane translocator  61.35 
 
 		 343 aa  339  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3014  ribose ABC transporter, permease protein, putative  46.33 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0563864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2264  putative ribose ABC transporter, permease protein  46.92 
 
 		 317 aa  242  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3016  putative ribose ABC transporter, permease protein  51.81 
 
 		 317 aa  241  9e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2695  sugar ABC transporter, permease  45.67 
 
 		 317 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2771  monosaccharide-transporting ATPase  49.62 
 
 		 322 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2978  putative ribose ABC transporter, permease protein  48.19 
 
 		 317 aa  238  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2765  ribose ABC transporter permease  45.67 
 
 		 317 aa  238  9e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.586648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2977  ribose ABC transporter permease  45.67 
 
 		 317 aa  238  9e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.807119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2973  putative ribose ABC transporter, permease protein  45.67 
 
 		 317 aa  238  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000373309 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2715  sugar ABC transporter, permease  45.67 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3502  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  50.18 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3148  inner-membrane translocator  49.82 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181607  normal  0.288762 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0709  inner-membrane translocator  36.83 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.999308  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3568  monosaccharide-transporting ATPase  35.39 
 
 		 332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  38.04 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  38.66 
 
 		 322 aa  155  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2605  Monosaccharide-transporting ATPase  34.2 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4072  inner-membrane translocator  30.09 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.549019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6712  inner-membrane translocator  30.47 
 
 		 333 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.769833 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5811  Monosaccharide-transporting ATPase  30.18 
 
 		 333 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0999426  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  37.23 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0416  Monosaccharide-transporting ATPase  32.78 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000387261  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  34 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  30.22 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  34.16 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  34.43 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  34.43 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0882  Monosaccharide-transporting ATPase  33.68 
 
 		 363 aa  146  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  36.12 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2432  putative binding-protein-dependent transport system permease  34.09 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  34.29 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2459  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  34.78 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  32.69 
 
 		 342 aa  143  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  36.36 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  34.38 
 
 		 334 aa  143  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 342 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 342 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 342 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  34.86 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.51 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  32.88 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  34.86 
 
 		 323 aa  142  9e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 		 311 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  34.42 
 
 		 311 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  34.06 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  34.86 
 
 		 835 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  32.73 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.42 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  34.06 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  34.06 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  33.94 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  34.25 
 
 		 354 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  34.42 
 
 		 311 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  33.82 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0835  monosaccharide-transporting ATPase  36.36 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4156  sugar transport system permease  29.58 
 
 		 394 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  33.01 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0059  monosaccharide-transporting ATPase  29.58 
 
 		 394 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0425  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.77 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4099  putative xylose transport system permease protein XylH  29.58 
 
 		 394 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0812  monosaccharide-transporting ATPase  36.36 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.213991  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  31.25 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1889  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3311  Monosaccharide-transporting ATPase  34.92 
 
 		 343 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  hitchhiker  0.00154614 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  34.67 
 
 		 324 aa  136  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 339 aa  136  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3700  inner-membrane translocator  31.25 
 
 		 339 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1036  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.6 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147412  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  32.25 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  34.74 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  35.14 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  34.29 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>