More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2354 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 279 aa  538  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  36.02 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  35.04 
 
 		 274 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  30.92 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  30.52 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5550  alpha/beta hydrolase fold  34.85 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5169  alpha/beta hydrolase fold  34.85 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5258  alpha/beta hydrolase fold  34.85 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  32.05 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  25.52 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 267 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 		 291 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2003  alpha/beta hydrolase fold protein  31.77 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0706427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15020  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.07 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 350 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3153  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 271 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0769848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3765  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00546797  normal  0.0830627 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1124  hydrolase/oxidase  25.87 
 
 		 292 aa  95.9  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 264 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2524  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191212  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 315 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 		 324 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.43 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0430  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4425  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 		 310 aa  89.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 		 350 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 295 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 302 aa  89  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  25.8 
 
 		 313 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  25.8 
 
 		 313 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 361 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4900  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000488276 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 298 aa  87  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  27.99 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 322 aa  85.9  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 290 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  32.81 
 
 		 404 aa  85.5  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 294 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  21.34 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  21.34 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  31.42 
 
 		 286 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  27.33 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  21.34 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  21.34 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.5 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  32.94 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  34.3 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  24.38 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  34.3 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  34.3 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1660  putative alpha/beta hydrolase  31.88 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  21.18 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  21.48 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  20.95 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  21.34 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  21.34 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3689  hypothetical protein  31.87 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29493  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6184  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893606  normal  0.450025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  22.13 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>