More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1620 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 465 aa  899    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.16 
 
 		 484 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  52 
 
 		 474 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6967  oxidoreductase, FAD-dependent  41.28 
 
 		 460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.5 
 
 		 462 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  37.14 
 
 		 462 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.14 
 
 		 462 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.7 
 
 		 460 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.01 
 
 		 462 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.44 
 
 		 473 aa  220  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  36.38 
 
 		 436 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  35.24 
 
 		 596 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  34.17 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  37.41 
 
 		 459 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  36.52 
 
 		 467 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1621  FAD linked oxidase domain protein  36.14 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2907  FAD linked oxidase domain protein  35.85 
 
 		 470 aa  183  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.777851  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3564  FAD linked oxidase domain protein  38.38 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.293473  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  33.55 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  34.63 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  35.48 
 
 		 436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.35 
 
 		 461 aa  173  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2915  FAD linked oxidase domain protein  37.16 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000548663  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  30.44 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  28.07 
 
 		 461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  30.67 
 
 		 499 aa  164  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  31.56 
 
 		 461 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2688  FAD linked oxidase domain protein  33.41 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.70388  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  30.31 
 
 		 479 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0394  FAD linked oxidase domain protein  34.58 
 
 		 441 aa  156  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  29.76 
 
 		 459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.63 
 
 		 464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  30.33 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  30.5 
 
 		 473 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  33.92 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.07 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  30.18 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.39 
 
 		 472 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  31.57 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  28.86 
 
 		 479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.65 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  29.98 
 
 		 463 aa  147  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  34.89 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  28.03 
 
 		 458 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  34.51 
 
 		 476 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  32.06 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.57 
 
 		 479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  28.42 
 
 		 474 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  31.64 
 
 		 460 aa  140  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2207  FAD linked oxidase domain protein  36.31 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  29.82 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  31.68 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  31.15 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 444 aa  139  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  31.81 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  30.95 
 
 		 477 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  29.46 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  31.74 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.05 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.96 
 
 		 448 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  36.04 
 
 		 705 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  31.07 
 
 		 602 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  29.91 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  26.86 
 
 		 479 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 758 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  31.14 
 
 		 461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  28.44 
 
 		 465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  26.79 
 
 		 473 aa  120  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  30.32 
 
 		 752 aa  120  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  36.92 
 
 		 462 aa  120  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.57 
 
 		 472 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  29.11 
 
 		 462 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  28.7 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  36.33 
 
 		 461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  27.23 
 
 		 465 aa  117  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.59 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  36.04 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  31.19 
 
 		 450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.45 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  38.97 
 
 		 466 aa  111  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.62 
 
 		 449 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  23.2 
 
 		 448 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  27.75 
 
 		 456 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.04 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  25.53 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.66 
 
 		 734 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  32.52 
 
 		 487 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  26.89 
 
 		 444 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  27.73 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.17 
 
 		 726 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.94 
 
 		 481 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.45 
 
 		 462 aa  100  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  32.04 
 
 		 447 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  31.78 
 
 		 458 aa  96.3  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  23.18 
 
 		 448 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  30.77 
 
 		 753 aa  95.5  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  35.61 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02387  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 502 aa  94.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 754 aa  94.4  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.56 
 
 		 490 aa  94  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>